Protein–RNA interactions for Protein: Q3TVC7

Ccndbp1, Cyclin-D1-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccndbp1Q3TVC7 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccndbp1Q3TVC7 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccndbp1Q3TVC7 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccndbp1Q3TVC7 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccndbp1Q3TVC7 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccndbp1Q3TVC7 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccndbp1Q3TVC7 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccndbp1Q3TVC7 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccndbp1Q3TVC7 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccndbp1Q3TVC7 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccndbp1Q3TVC7 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccndbp1Q3TVC7 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccndbp1Q3TVC7 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccndbp1Q3TVC7 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccndbp1Q3TVC7 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccndbp1Q3TVC7 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccndbp1Q3TVC7 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccndbp1Q3TVC7 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccndbp1Q3TVC7 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccndbp1Q3TVC7 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccndbp1Q3TVC7 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccndbp1Q3TVC7 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccndbp1Q3TVC7 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccndbp1Q3TVC7 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccndbp1Q3TVC7 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccndbp1Q3TVC7 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccndbp1Q3TVC7 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccndbp1Q3TVC7 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccndbp1Q3TVC7 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccndbp1Q3TVC7 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccndbp1Q3TVC7 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccndbp1Q3TVC7 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccndbp1Q3TVC7 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccndbp1Q3TVC7 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccndbp1Q3TVC7 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccndbp1Q3TVC7 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccndbp1Q3TVC7 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccndbp1Q3TVC7 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccndbp1Q3TVC7 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccndbp1Q3TVC7 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccndbp1Q3TVC7 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccndbp1Q3TVC7 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccndbp1Q3TVC7 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccndbp1Q3TVC7 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccndbp1Q3TVC7 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccndbp1Q3TVC7 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccndbp1Q3TVC7 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccndbp1Q3TVC7 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccndbp1Q3TVC7 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccndbp1Q3TVC7 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccndbp1Q3TVC7 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccndbp1Q3TVC7 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccndbp1Q3TVC7 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccndbp1Q3TVC7 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccndbp1Q3TVC7 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccndbp1Q3TVC7 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccndbp1Q3TVC7 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccndbp1Q3TVC7 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccndbp1Q3TVC7 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccndbp1Q3TVC7 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccndbp1Q3TVC7 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccndbp1Q3TVC7 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccndbp1Q3TVC7 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccndbp1Q3TVC7 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Ccndbp1Q3TVC7 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Ccndbp1Q3TVC7 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Ccndbp1Q3TVC7 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccndbp1Q3TVC7 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccndbp1Q3TVC7 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccndbp1Q3TVC7 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccndbp1Q3TVC7 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccndbp1Q3TVC7 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccndbp1Q3TVC7 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccndbp1Q3TVC7 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccndbp1Q3TVC7 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccndbp1Q3TVC7 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccndbp1Q3TVC7 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccndbp1Q3TVC7 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccndbp1Q3TVC7 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccndbp1Q3TVC7 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccndbp1Q3TVC7 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccndbp1Q3TVC7 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccndbp1Q3TVC7 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccndbp1Q3TVC7 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccndbp1Q3TVC7 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccndbp1Q3TVC7 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccndbp1Q3TVC7 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccndbp1Q3TVC7 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccndbp1Q3TVC7 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccndbp1Q3TVC7 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccndbp1Q3TVC7 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccndbp1Q3TVC7 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccndbp1Q3TVC7 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccndbp1Q3TVC7 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccndbp1Q3TVC7 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccndbp1Q3TVC7 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccndbp1Q3TVC7 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccndbp1Q3TVC7 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccndbp1Q3TVC7 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccndbp1Q3TVC7 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms