Protein–RNA interactions for Protein: Q3TVA9

Ccdc136, Coiled-coil domain-containing protein 136, mousemouse

Predictions only

Length 1,136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc136Q3TVA9 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
Ccdc136Q3TVA9 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
Ccdc136Q3TVA9 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
Ccdc136Q3TVA9 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC30.39■■■□□ 2.46
Ccdc136Q3TVA9 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC30.39■■■□□ 2.46
Ccdc136Q3TVA9 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC30.39■■■□□ 2.46
Ccdc136Q3TVA9 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
Ccdc136Q3TVA9 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
Ccdc136Q3TVA9 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
Ccdc136Q3TVA9 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
Ccdc136Q3TVA9 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC30.38■■■□□ 2.45
Ccdc136Q3TVA9 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
Ccdc136Q3TVA9 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
Ccdc136Q3TVA9 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
Ccdc136Q3TVA9 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
Ccdc136Q3TVA9 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
Ccdc136Q3TVA9 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC30.37■■■□□ 2.45
Ccdc136Q3TVA9 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC30.37■■■□□ 2.45
Ccdc136Q3TVA9 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
Ccdc136Q3TVA9 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
Ccdc136Q3TVA9 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
Ccdc136Q3TVA9 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC30.37■■■□□ 2.45
Ccdc136Q3TVA9 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
Ccdc136Q3TVA9 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
Ccdc136Q3TVA9 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC30.37■■■□□ 2.45
Ccdc136Q3TVA9 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
Ccdc136Q3TVA9 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
Ccdc136Q3TVA9 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC30.36■■■□□ 2.45
Ccdc136Q3TVA9 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
Ccdc136Q3TVA9 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
Ccdc136Q3TVA9 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.36■■■□□ 2.45
Ccdc136Q3TVA9 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC30.36■■■□□ 2.45
Ccdc136Q3TVA9 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
Ccdc136Q3TVA9 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
Ccdc136Q3TVA9 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC30.36■■■□□ 2.45
Ccdc136Q3TVA9 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC30.35■■■□□ 2.45
Ccdc136Q3TVA9 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
Ccdc136Q3TVA9 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC30.35■■■□□ 2.45
Ccdc136Q3TVA9 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
Ccdc136Q3TVA9 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC30.35■■■□□ 2.45
Ccdc136Q3TVA9 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.35■■■□□ 2.45
Ccdc136Q3TVA9 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
Ccdc136Q3TVA9 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC30.35■■■□□ 2.45
Ccdc136Q3TVA9 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
Ccdc136Q3TVA9 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
Ccdc136Q3TVA9 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
Ccdc136Q3TVA9 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
Ccdc136Q3TVA9 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
Ccdc136Q3TVA9 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
Ccdc136Q3TVA9 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
Ccdc136Q3TVA9 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
Ccdc136Q3TVA9 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
Ccdc136Q3TVA9 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
Ccdc136Q3TVA9 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
Ccdc136Q3TVA9 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
Ccdc136Q3TVA9 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
Ccdc136Q3TVA9 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
Ccdc136Q3TVA9 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
Ccdc136Q3TVA9 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
Ccdc136Q3TVA9 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
Ccdc136Q3TVA9 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
Ccdc136Q3TVA9 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.33■■■□□ 2.45
Ccdc136Q3TVA9 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC30.33■■■□□ 2.45
Ccdc136Q3TVA9 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC30.33■■■□□ 2.45
Ccdc136Q3TVA9 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
Ccdc136Q3TVA9 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
Ccdc136Q3TVA9 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC30.33■■■□□ 2.45
Ccdc136Q3TVA9 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC30.33■■■□□ 2.45
Ccdc136Q3TVA9 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC30.33■■■□□ 2.45
Ccdc136Q3TVA9 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
Ccdc136Q3TVA9 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
Ccdc136Q3TVA9 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
Ccdc136Q3TVA9 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
Ccdc136Q3TVA9 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
Ccdc136Q3TVA9 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
Ccdc136Q3TVA9 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
Ccdc136Q3TVA9 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
Ccdc136Q3TVA9 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
Ccdc136Q3TVA9 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC30.32■■■□□ 2.44
Ccdc136Q3TVA9 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
Ccdc136Q3TVA9 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
Ccdc136Q3TVA9 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
Ccdc136Q3TVA9 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC30.31■■■□□ 2.44
Ccdc136Q3TVA9 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC30.31■■■□□ 2.44
Ccdc136Q3TVA9 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
Ccdc136Q3TVA9 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.31■■■□□ 2.44
Ccdc136Q3TVA9 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC30.31■■■□□ 2.44
Ccdc136Q3TVA9 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC30.31■■■□□ 2.44
Ccdc136Q3TVA9 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
Ccdc136Q3TVA9 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC30.31■■■□□ 2.44
Ccdc136Q3TVA9 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
Ccdc136Q3TVA9 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
Ccdc136Q3TVA9 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
Ccdc136Q3TVA9 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
Ccdc136Q3TVA9 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
Ccdc136Q3TVA9 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
Ccdc136Q3TVA9 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC30.3■■■□□ 2.44
Ccdc136Q3TVA9 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
Ccdc136Q3TVA9 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
Ccdc136Q3TVA9 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC30.3■■■□□ 2.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 97.5 ms