Protein–RNA interactions for Protein: Q3TT38

D17Wsu92e, Uncharacterized protein C6orf106 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D17Wsu92eQ3TT38 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
D17Wsu92eQ3TT38 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
D17Wsu92eQ3TT38 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
D17Wsu92eQ3TT38 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
D17Wsu92eQ3TT38 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
D17Wsu92eQ3TT38 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
D17Wsu92eQ3TT38 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
D17Wsu92eQ3TT38 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
D17Wsu92eQ3TT38 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
D17Wsu92eQ3TT38 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
D17Wsu92eQ3TT38 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
D17Wsu92eQ3TT38 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
D17Wsu92eQ3TT38 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
D17Wsu92eQ3TT38 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
D17Wsu92eQ3TT38 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
D17Wsu92eQ3TT38 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
D17Wsu92eQ3TT38 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
D17Wsu92eQ3TT38 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
D17Wsu92eQ3TT38 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
D17Wsu92eQ3TT38 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
D17Wsu92eQ3TT38 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
D17Wsu92eQ3TT38 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
D17Wsu92eQ3TT38 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
D17Wsu92eQ3TT38 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
D17Wsu92eQ3TT38 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
D17Wsu92eQ3TT38 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
D17Wsu92eQ3TT38 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
D17Wsu92eQ3TT38 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
D17Wsu92eQ3TT38 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
D17Wsu92eQ3TT38 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
D17Wsu92eQ3TT38 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
D17Wsu92eQ3TT38 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
D17Wsu92eQ3TT38 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
D17Wsu92eQ3TT38 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
D17Wsu92eQ3TT38 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
D17Wsu92eQ3TT38 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
D17Wsu92eQ3TT38 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
D17Wsu92eQ3TT38 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
D17Wsu92eQ3TT38 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
D17Wsu92eQ3TT38 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC17■□□□□ 0.31
D17Wsu92eQ3TT38 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
D17Wsu92eQ3TT38 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
D17Wsu92eQ3TT38 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
D17Wsu92eQ3TT38 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
D17Wsu92eQ3TT38 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
D17Wsu92eQ3TT38 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
D17Wsu92eQ3TT38 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
D17Wsu92eQ3TT38 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
D17Wsu92eQ3TT38 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
D17Wsu92eQ3TT38 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
D17Wsu92eQ3TT38 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
D17Wsu92eQ3TT38 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
D17Wsu92eQ3TT38 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
D17Wsu92eQ3TT38 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
D17Wsu92eQ3TT38 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
D17Wsu92eQ3TT38 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
D17Wsu92eQ3TT38 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
D17Wsu92eQ3TT38 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
D17Wsu92eQ3TT38 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
D17Wsu92eQ3TT38 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
D17Wsu92eQ3TT38 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
D17Wsu92eQ3TT38 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
D17Wsu92eQ3TT38 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
D17Wsu92eQ3TT38 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
D17Wsu92eQ3TT38 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
D17Wsu92eQ3TT38 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
D17Wsu92eQ3TT38 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
D17Wsu92eQ3TT38 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
D17Wsu92eQ3TT38 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
D17Wsu92eQ3TT38 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
D17Wsu92eQ3TT38 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
D17Wsu92eQ3TT38 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
D17Wsu92eQ3TT38 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
D17Wsu92eQ3TT38 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
D17Wsu92eQ3TT38 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
D17Wsu92eQ3TT38 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
D17Wsu92eQ3TT38 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
D17Wsu92eQ3TT38 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
D17Wsu92eQ3TT38 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
D17Wsu92eQ3TT38 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
D17Wsu92eQ3TT38 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
D17Wsu92eQ3TT38 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
D17Wsu92eQ3TT38 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
D17Wsu92eQ3TT38 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
D17Wsu92eQ3TT38 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
D17Wsu92eQ3TT38 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
D17Wsu92eQ3TT38 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
D17Wsu92eQ3TT38 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
D17Wsu92eQ3TT38 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
D17Wsu92eQ3TT38 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
D17Wsu92eQ3TT38 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
D17Wsu92eQ3TT38 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
D17Wsu92eQ3TT38 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
D17Wsu92eQ3TT38 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
D17Wsu92eQ3TT38 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
D17Wsu92eQ3TT38 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
D17Wsu92eQ3TT38 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
D17Wsu92eQ3TT38 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
D17Wsu92eQ3TT38 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
D17Wsu92eQ3TT38 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.2 ms