Protein–RNA interactions for Protein: Q3TS39

1700066B19Rik, RIKEN cDNA 1700066B19 gene, mousemouse

Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700066B19RikQ3TS39 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
1700066B19RikQ3TS39 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
1700066B19RikQ3TS39 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
1700066B19RikQ3TS39 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
1700066B19RikQ3TS39 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
1700066B19RikQ3TS39 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
1700066B19RikQ3TS39 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
1700066B19RikQ3TS39 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
1700066B19RikQ3TS39 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
1700066B19RikQ3TS39 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
1700066B19RikQ3TS39 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
1700066B19RikQ3TS39 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
1700066B19RikQ3TS39 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
1700066B19RikQ3TS39 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
1700066B19RikQ3TS39 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
1700066B19RikQ3TS39 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
1700066B19RikQ3TS39 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
1700066B19RikQ3TS39 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
1700066B19RikQ3TS39 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
1700066B19RikQ3TS39 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
1700066B19RikQ3TS39 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
1700066B19RikQ3TS39 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
1700066B19RikQ3TS39 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
1700066B19RikQ3TS39 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
1700066B19RikQ3TS39 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
1700066B19RikQ3TS39 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
1700066B19RikQ3TS39 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
1700066B19RikQ3TS39 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
1700066B19RikQ3TS39 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
1700066B19RikQ3TS39 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
1700066B19RikQ3TS39 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
1700066B19RikQ3TS39 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
1700066B19RikQ3TS39 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
1700066B19RikQ3TS39 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
1700066B19RikQ3TS39 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
1700066B19RikQ3TS39 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
1700066B19RikQ3TS39 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
1700066B19RikQ3TS39 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
1700066B19RikQ3TS39 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
1700066B19RikQ3TS39 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
1700066B19RikQ3TS39 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
1700066B19RikQ3TS39 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
1700066B19RikQ3TS39 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
1700066B19RikQ3TS39 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
1700066B19RikQ3TS39 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
1700066B19RikQ3TS39 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
1700066B19RikQ3TS39 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
1700066B19RikQ3TS39 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
1700066B19RikQ3TS39 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
1700066B19RikQ3TS39 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
1700066B19RikQ3TS39 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
1700066B19RikQ3TS39 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
1700066B19RikQ3TS39 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
1700066B19RikQ3TS39 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
1700066B19RikQ3TS39 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
1700066B19RikQ3TS39 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
1700066B19RikQ3TS39 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
1700066B19RikQ3TS39 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
1700066B19RikQ3TS39 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
1700066B19RikQ3TS39 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
1700066B19RikQ3TS39 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
1700066B19RikQ3TS39 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
1700066B19RikQ3TS39 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
1700066B19RikQ3TS39 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
1700066B19RikQ3TS39 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
1700066B19RikQ3TS39 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
1700066B19RikQ3TS39 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
1700066B19RikQ3TS39 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
1700066B19RikQ3TS39 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
1700066B19RikQ3TS39 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
1700066B19RikQ3TS39 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
1700066B19RikQ3TS39 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
1700066B19RikQ3TS39 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
1700066B19RikQ3TS39 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
1700066B19RikQ3TS39 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
1700066B19RikQ3TS39 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
1700066B19RikQ3TS39 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
1700066B19RikQ3TS39 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
1700066B19RikQ3TS39 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
1700066B19RikQ3TS39 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
1700066B19RikQ3TS39 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
1700066B19RikQ3TS39 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
1700066B19RikQ3TS39 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
1700066B19RikQ3TS39 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
1700066B19RikQ3TS39 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
1700066B19RikQ3TS39 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
1700066B19RikQ3TS39 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
1700066B19RikQ3TS39 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
1700066B19RikQ3TS39 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
1700066B19RikQ3TS39 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
1700066B19RikQ3TS39 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
1700066B19RikQ3TS39 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
1700066B19RikQ3TS39 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
1700066B19RikQ3TS39 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
1700066B19RikQ3TS39 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
1700066B19RikQ3TS39 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
1700066B19RikQ3TS39 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
1700066B19RikQ3TS39 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
1700066B19RikQ3TS39 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
1700066B19RikQ3TS39 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms