Protein–RNA interactions for Protein: Q3TQS0

Calr4, Calreticulin 4, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calr4Q3TQS0 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Calr4Q3TQS0 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Calr4Q3TQS0 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Calr4Q3TQS0 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Calr4Q3TQS0 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Calr4Q3TQS0 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Calr4Q3TQS0 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Calr4Q3TQS0 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Calr4Q3TQS0 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Calr4Q3TQS0 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Calr4Q3TQS0 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Calr4Q3TQS0 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Calr4Q3TQS0 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Calr4Q3TQS0 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Calr4Q3TQS0 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Calr4Q3TQS0 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Calr4Q3TQS0 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Calr4Q3TQS0 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Calr4Q3TQS0 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Calr4Q3TQS0 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Calr4Q3TQS0 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Calr4Q3TQS0 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Calr4Q3TQS0 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Calr4Q3TQS0 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Calr4Q3TQS0 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Calr4Q3TQS0 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Calr4Q3TQS0 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Calr4Q3TQS0 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Calr4Q3TQS0 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Calr4Q3TQS0 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Calr4Q3TQS0 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Calr4Q3TQS0 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Calr4Q3TQS0 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Calr4Q3TQS0 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Calr4Q3TQS0 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Calr4Q3TQS0 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Calr4Q3TQS0 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Calr4Q3TQS0 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Calr4Q3TQS0 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Calr4Q3TQS0 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Calr4Q3TQS0 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Calr4Q3TQS0 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Calr4Q3TQS0 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Calr4Q3TQS0 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Calr4Q3TQS0 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Calr4Q3TQS0 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Calr4Q3TQS0 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Calr4Q3TQS0 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Calr4Q3TQS0 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Calr4Q3TQS0 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Calr4Q3TQS0 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Calr4Q3TQS0 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Calr4Q3TQS0 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Calr4Q3TQS0 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Calr4Q3TQS0 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Calr4Q3TQS0 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Calr4Q3TQS0 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Calr4Q3TQS0 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Calr4Q3TQS0 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Calr4Q3TQS0 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Calr4Q3TQS0 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Calr4Q3TQS0 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Calr4Q3TQS0 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Calr4Q3TQS0 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Calr4Q3TQS0 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Calr4Q3TQS0 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Calr4Q3TQS0 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Calr4Q3TQS0 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Calr4Q3TQS0 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Calr4Q3TQS0 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Calr4Q3TQS0 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Calr4Q3TQS0 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Calr4Q3TQS0 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Calr4Q3TQS0 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Calr4Q3TQS0 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Calr4Q3TQS0 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Calr4Q3TQS0 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Calr4Q3TQS0 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Calr4Q3TQS0 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Calr4Q3TQS0 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Calr4Q3TQS0 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Calr4Q3TQS0 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Calr4Q3TQS0 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Calr4Q3TQS0 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Calr4Q3TQS0 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Calr4Q3TQS0 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Calr4Q3TQS0 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Calr4Q3TQS0 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Calr4Q3TQS0 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Calr4Q3TQS0 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Calr4Q3TQS0 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Calr4Q3TQS0 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Calr4Q3TQS0 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Calr4Q3TQS0 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Calr4Q3TQS0 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Calr4Q3TQS0 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Calr4Q3TQS0 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Calr4Q3TQS0 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Calr4Q3TQS0 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Calr4Q3TQS0 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.1 ms