Protein–RNA interactions for Protein: Q3TMW1

Ccdc102a, Coiled-coil domain-containing protein 102A, mousemouse

Predictions only

Length 549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc102aQ3TMW1 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc102aQ3TMW1 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc102aQ3TMW1 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc102aQ3TMW1 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc102aQ3TMW1 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc102aQ3TMW1 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc102aQ3TMW1 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc102aQ3TMW1 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc102aQ3TMW1 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc102aQ3TMW1 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc102aQ3TMW1 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc102aQ3TMW1 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc102aQ3TMW1 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc102aQ3TMW1 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc102aQ3TMW1 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc102aQ3TMW1 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc102aQ3TMW1 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc102aQ3TMW1 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc102aQ3TMW1 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc102aQ3TMW1 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc102aQ3TMW1 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc102aQ3TMW1 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc102aQ3TMW1 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc102aQ3TMW1 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc102aQ3TMW1 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc102aQ3TMW1 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc102aQ3TMW1 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc102aQ3TMW1 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc102aQ3TMW1 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc102aQ3TMW1 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc102aQ3TMW1 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc102aQ3TMW1 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc102aQ3TMW1 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc102aQ3TMW1 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc102aQ3TMW1 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc102aQ3TMW1 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc102aQ3TMW1 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc102aQ3TMW1 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc102aQ3TMW1 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc102aQ3TMW1 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc102aQ3TMW1 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc102aQ3TMW1 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc102aQ3TMW1 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc102aQ3TMW1 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc102aQ3TMW1 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc102aQ3TMW1 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc102aQ3TMW1 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc102aQ3TMW1 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc102aQ3TMW1 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc102aQ3TMW1 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc102aQ3TMW1 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc102aQ3TMW1 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc102aQ3TMW1 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc102aQ3TMW1 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc102aQ3TMW1 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc102aQ3TMW1 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc102aQ3TMW1 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc102aQ3TMW1 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc102aQ3TMW1 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc102aQ3TMW1 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc102aQ3TMW1 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc102aQ3TMW1 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc102aQ3TMW1 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc102aQ3TMW1 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc102aQ3TMW1 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc102aQ3TMW1 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc102aQ3TMW1 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc102aQ3TMW1 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc102aQ3TMW1 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc102aQ3TMW1 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc102aQ3TMW1 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc102aQ3TMW1 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc102aQ3TMW1 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc102aQ3TMW1 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc102aQ3TMW1 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc102aQ3TMW1 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc102aQ3TMW1 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc102aQ3TMW1 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc102aQ3TMW1 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc102aQ3TMW1 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc102aQ3TMW1 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc102aQ3TMW1 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc102aQ3TMW1 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc102aQ3TMW1 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc102aQ3TMW1 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc102aQ3TMW1 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc102aQ3TMW1 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc102aQ3TMW1 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc102aQ3TMW1 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc102aQ3TMW1 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc102aQ3TMW1 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc102aQ3TMW1 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc102aQ3TMW1 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc102aQ3TMW1 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc102aQ3TMW1 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc102aQ3TMW1 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc102aQ3TMW1 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc102aQ3TMW1 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc102aQ3TMW1 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc102aQ3TMW1 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms