Protein–RNA interactions for Protein: Q3TKY6

Cwc27, Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase CWC27 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cwc27Q3TKY6 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cwc27Q3TKY6 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cwc27Q3TKY6 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cwc27Q3TKY6 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cwc27Q3TKY6 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cwc27Q3TKY6 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cwc27Q3TKY6 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cwc27Q3TKY6 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cwc27Q3TKY6 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cwc27Q3TKY6 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cwc27Q3TKY6 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cwc27Q3TKY6 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cwc27Q3TKY6 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cwc27Q3TKY6 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cwc27Q3TKY6 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cwc27Q3TKY6 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cwc27Q3TKY6 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cwc27Q3TKY6 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Cwc27Q3TKY6 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Cwc27Q3TKY6 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cwc27Q3TKY6 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cwc27Q3TKY6 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cwc27Q3TKY6 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cwc27Q3TKY6 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cwc27Q3TKY6 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cwc27Q3TKY6 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cwc27Q3TKY6 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cwc27Q3TKY6 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cwc27Q3TKY6 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cwc27Q3TKY6 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cwc27Q3TKY6 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cwc27Q3TKY6 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cwc27Q3TKY6 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cwc27Q3TKY6 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cwc27Q3TKY6 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cwc27Q3TKY6 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cwc27Q3TKY6 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cwc27Q3TKY6 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Cwc27Q3TKY6 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cwc27Q3TKY6 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cwc27Q3TKY6 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Cwc27Q3TKY6 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cwc27Q3TKY6 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cwc27Q3TKY6 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cwc27Q3TKY6 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cwc27Q3TKY6 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cwc27Q3TKY6 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cwc27Q3TKY6 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cwc27Q3TKY6 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cwc27Q3TKY6 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cwc27Q3TKY6 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cwc27Q3TKY6 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cwc27Q3TKY6 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Cwc27Q3TKY6 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cwc27Q3TKY6 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cwc27Q3TKY6 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cwc27Q3TKY6 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cwc27Q3TKY6 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cwc27Q3TKY6 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cwc27Q3TKY6 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cwc27Q3TKY6 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cwc27Q3TKY6 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cwc27Q3TKY6 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cwc27Q3TKY6 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cwc27Q3TKY6 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cwc27Q3TKY6 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cwc27Q3TKY6 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cwc27Q3TKY6 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Cwc27Q3TKY6 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Cwc27Q3TKY6 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
Cwc27Q3TKY6 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Cwc27Q3TKY6 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cwc27Q3TKY6 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cwc27Q3TKY6 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cwc27Q3TKY6 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cwc27Q3TKY6 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Cwc27Q3TKY6 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cwc27Q3TKY6 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cwc27Q3TKY6 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cwc27Q3TKY6 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cwc27Q3TKY6 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cwc27Q3TKY6 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cwc27Q3TKY6 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cwc27Q3TKY6 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cwc27Q3TKY6 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cwc27Q3TKY6 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cwc27Q3TKY6 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cwc27Q3TKY6 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cwc27Q3TKY6 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cwc27Q3TKY6 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cwc27Q3TKY6 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cwc27Q3TKY6 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cwc27Q3TKY6 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cwc27Q3TKY6 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cwc27Q3TKY6 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cwc27Q3TKY6 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cwc27Q3TKY6 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Cwc27Q3TKY6 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cwc27Q3TKY6 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cwc27Q3TKY6 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms