Protein–RNA interactions for Protein: Q3TIX9

Usp39, U4/U6.U5 tri-snRNP-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 564 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp39Q3TIX9 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Usp39Q3TIX9 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Usp39Q3TIX9 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Usp39Q3TIX9 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Usp39Q3TIX9 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Usp39Q3TIX9 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Usp39Q3TIX9 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Usp39Q3TIX9 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Usp39Q3TIX9 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Usp39Q3TIX9 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Usp39Q3TIX9 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Usp39Q3TIX9 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Usp39Q3TIX9 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Usp39Q3TIX9 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Usp39Q3TIX9 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Usp39Q3TIX9 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Usp39Q3TIX9 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Usp39Q3TIX9 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Usp39Q3TIX9 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Usp39Q3TIX9 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Usp39Q3TIX9 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Usp39Q3TIX9 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Usp39Q3TIX9 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Usp39Q3TIX9 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Usp39Q3TIX9 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Usp39Q3TIX9 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Usp39Q3TIX9 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Usp39Q3TIX9 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Usp39Q3TIX9 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Usp39Q3TIX9 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Usp39Q3TIX9 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Usp39Q3TIX9 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Usp39Q3TIX9 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Usp39Q3TIX9 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Usp39Q3TIX9 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Usp39Q3TIX9 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Usp39Q3TIX9 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Usp39Q3TIX9 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Usp39Q3TIX9 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Usp39Q3TIX9 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Usp39Q3TIX9 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Usp39Q3TIX9 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Usp39Q3TIX9 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Usp39Q3TIX9 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Usp39Q3TIX9 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Usp39Q3TIX9 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Usp39Q3TIX9 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Usp39Q3TIX9 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Usp39Q3TIX9 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Usp39Q3TIX9 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Usp39Q3TIX9 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Usp39Q3TIX9 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Usp39Q3TIX9 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Usp39Q3TIX9 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Usp39Q3TIX9 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Usp39Q3TIX9 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Usp39Q3TIX9 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Usp39Q3TIX9 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Usp39Q3TIX9 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Usp39Q3TIX9 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Usp39Q3TIX9 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Usp39Q3TIX9 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Usp39Q3TIX9 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Usp39Q3TIX9 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Usp39Q3TIX9 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Usp39Q3TIX9 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Usp39Q3TIX9 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Usp39Q3TIX9 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Usp39Q3TIX9 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Usp39Q3TIX9 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Usp39Q3TIX9 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Usp39Q3TIX9 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Usp39Q3TIX9 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Usp39Q3TIX9 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Usp39Q3TIX9 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Usp39Q3TIX9 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Usp39Q3TIX9 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Usp39Q3TIX9 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Usp39Q3TIX9 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Usp39Q3TIX9 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Usp39Q3TIX9 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Usp39Q3TIX9 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Usp39Q3TIX9 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Usp39Q3TIX9 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Usp39Q3TIX9 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Usp39Q3TIX9 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Usp39Q3TIX9 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Usp39Q3TIX9 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Usp39Q3TIX9 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Usp39Q3TIX9 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Usp39Q3TIX9 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Usp39Q3TIX9 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Usp39Q3TIX9 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Usp39Q3TIX9 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Usp39Q3TIX9 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Usp39Q3TIX9 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Usp39Q3TIX9 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Usp39Q3TIX9 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Usp39Q3TIX9 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Usp39Q3TIX9 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms