Protein–RNA interactions for Protein: Q3TIR1

Trappc13, Trafficking protein particle complex subunit 13, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc13Q3TIR1 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trappc13Q3TIR1 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trappc13Q3TIR1 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trappc13Q3TIR1 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trappc13Q3TIR1 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trappc13Q3TIR1 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trappc13Q3TIR1 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trappc13Q3TIR1 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trappc13Q3TIR1 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trappc13Q3TIR1 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Trappc13Q3TIR1 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trappc13Q3TIR1 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trappc13Q3TIR1 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trappc13Q3TIR1 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trappc13Q3TIR1 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Trappc13Q3TIR1 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trappc13Q3TIR1 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trappc13Q3TIR1 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trappc13Q3TIR1 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trappc13Q3TIR1 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Trappc13Q3TIR1 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trappc13Q3TIR1 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Trappc13Q3TIR1 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trappc13Q3TIR1 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trappc13Q3TIR1 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trappc13Q3TIR1 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trappc13Q3TIR1 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trappc13Q3TIR1 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trappc13Q3TIR1 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trappc13Q3TIR1 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trappc13Q3TIR1 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trappc13Q3TIR1 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trappc13Q3TIR1 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trappc13Q3TIR1 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trappc13Q3TIR1 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trappc13Q3TIR1 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trappc13Q3TIR1 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trappc13Q3TIR1 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trappc13Q3TIR1 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trappc13Q3TIR1 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trappc13Q3TIR1 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Trappc13Q3TIR1 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trappc13Q3TIR1 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Trappc13Q3TIR1 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trappc13Q3TIR1 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trappc13Q3TIR1 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trappc13Q3TIR1 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trappc13Q3TIR1 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trappc13Q3TIR1 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trappc13Q3TIR1 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trappc13Q3TIR1 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trappc13Q3TIR1 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trappc13Q3TIR1 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trappc13Q3TIR1 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trappc13Q3TIR1 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trappc13Q3TIR1 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trappc13Q3TIR1 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trappc13Q3TIR1 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trappc13Q3TIR1 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trappc13Q3TIR1 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trappc13Q3TIR1 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trappc13Q3TIR1 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trappc13Q3TIR1 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trappc13Q3TIR1 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trappc13Q3TIR1 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trappc13Q3TIR1 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trappc13Q3TIR1 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trappc13Q3TIR1 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trappc13Q3TIR1 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Trappc13Q3TIR1 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Trappc13Q3TIR1 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Trappc13Q3TIR1 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Trappc13Q3TIR1 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trappc13Q3TIR1 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trappc13Q3TIR1 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trappc13Q3TIR1 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trappc13Q3TIR1 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trappc13Q3TIR1 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Trappc13Q3TIR1 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Trappc13Q3TIR1 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Trappc13Q3TIR1 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trappc13Q3TIR1 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Trappc13Q3TIR1 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trappc13Q3TIR1 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trappc13Q3TIR1 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trappc13Q3TIR1 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trappc13Q3TIR1 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trappc13Q3TIR1 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trappc13Q3TIR1 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trappc13Q3TIR1 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trappc13Q3TIR1 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trappc13Q3TIR1 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trappc13Q3TIR1 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Trappc13Q3TIR1 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trappc13Q3TIR1 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trappc13Q3TIR1 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trappc13Q3TIR1 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trappc13Q3TIR1 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trappc13Q3TIR1 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trappc13Q3TIR1 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.1 ms