Protein–RNA interactions for Protein: Q3KNY5

Riiad1, RIIa domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 119 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Riiad1Q3KNY5 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Riiad1Q3KNY5 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Riiad1Q3KNY5 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Riiad1Q3KNY5 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Riiad1Q3KNY5 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Riiad1Q3KNY5 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Riiad1Q3KNY5 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Riiad1Q3KNY5 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Riiad1Q3KNY5 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Riiad1Q3KNY5 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Riiad1Q3KNY5 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Riiad1Q3KNY5 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Riiad1Q3KNY5 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Riiad1Q3KNY5 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Riiad1Q3KNY5 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Riiad1Q3KNY5 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Riiad1Q3KNY5 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Riiad1Q3KNY5 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Riiad1Q3KNY5 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Riiad1Q3KNY5 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Riiad1Q3KNY5 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Riiad1Q3KNY5 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Riiad1Q3KNY5 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Riiad1Q3KNY5 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Riiad1Q3KNY5 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Riiad1Q3KNY5 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Riiad1Q3KNY5 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Riiad1Q3KNY5 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Riiad1Q3KNY5 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Riiad1Q3KNY5 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Riiad1Q3KNY5 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Riiad1Q3KNY5 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Riiad1Q3KNY5 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Riiad1Q3KNY5 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Riiad1Q3KNY5 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Riiad1Q3KNY5 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Riiad1Q3KNY5 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Riiad1Q3KNY5 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Riiad1Q3KNY5 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Riiad1Q3KNY5 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Riiad1Q3KNY5 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Riiad1Q3KNY5 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Riiad1Q3KNY5 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Riiad1Q3KNY5 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Riiad1Q3KNY5 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Riiad1Q3KNY5 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Riiad1Q3KNY5 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Riiad1Q3KNY5 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Riiad1Q3KNY5 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Riiad1Q3KNY5 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Riiad1Q3KNY5 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Riiad1Q3KNY5 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Riiad1Q3KNY5 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Riiad1Q3KNY5 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Riiad1Q3KNY5 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Riiad1Q3KNY5 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Riiad1Q3KNY5 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Riiad1Q3KNY5 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Riiad1Q3KNY5 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Riiad1Q3KNY5 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Riiad1Q3KNY5 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Riiad1Q3KNY5 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Riiad1Q3KNY5 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Riiad1Q3KNY5 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Riiad1Q3KNY5 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Riiad1Q3KNY5 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Riiad1Q3KNY5 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Riiad1Q3KNY5 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Riiad1Q3KNY5 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Riiad1Q3KNY5 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Riiad1Q3KNY5 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Riiad1Q3KNY5 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Riiad1Q3KNY5 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Riiad1Q3KNY5 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Riiad1Q3KNY5 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Riiad1Q3KNY5 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Riiad1Q3KNY5 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Riiad1Q3KNY5 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Riiad1Q3KNY5 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Riiad1Q3KNY5 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Riiad1Q3KNY5 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Riiad1Q3KNY5 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Riiad1Q3KNY5 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Riiad1Q3KNY5 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Riiad1Q3KNY5 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Riiad1Q3KNY5 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Riiad1Q3KNY5 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Riiad1Q3KNY5 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Riiad1Q3KNY5 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Riiad1Q3KNY5 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Riiad1Q3KNY5 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Riiad1Q3KNY5 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Riiad1Q3KNY5 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Riiad1Q3KNY5 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Riiad1Q3KNY5 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Riiad1Q3KNY5 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Riiad1Q3KNY5 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Riiad1Q3KNY5 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Riiad1Q3KNY5 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Riiad1Q3KNY5 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms