Protein–RNA interactions for Protein: Q149F1

Rpusd2, RNA pseudouridylate synthase domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 553 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd2Q149F1 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Rpusd2Q149F1 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Rpusd2Q149F1 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rpusd2Q149F1 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rpusd2Q149F1 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rpusd2Q149F1 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rpusd2Q149F1 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rpusd2Q149F1 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rpusd2Q149F1 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rpusd2Q149F1 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rpusd2Q149F1 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Rpusd2Q149F1 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Rpusd2Q149F1 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rpusd2Q149F1 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rpusd2Q149F1 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rpusd2Q149F1 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rpusd2Q149F1 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rpusd2Q149F1 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rpusd2Q149F1 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rpusd2Q149F1 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rpusd2Q149F1 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rpusd2Q149F1 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rpusd2Q149F1 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rpusd2Q149F1 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rpusd2Q149F1 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rpusd2Q149F1 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rpusd2Q149F1 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rpusd2Q149F1 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rpusd2Q149F1 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rpusd2Q149F1 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rpusd2Q149F1 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Rpusd2Q149F1 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Rpusd2Q149F1 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rpusd2Q149F1 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rpusd2Q149F1 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rpusd2Q149F1 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rpusd2Q149F1 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Rpusd2Q149F1 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rpusd2Q149F1 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rpusd2Q149F1 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rpusd2Q149F1 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Rpusd2Q149F1 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rpusd2Q149F1 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rpusd2Q149F1 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rpusd2Q149F1 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rpusd2Q149F1 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rpusd2Q149F1 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Rpusd2Q149F1 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rpusd2Q149F1 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rpusd2Q149F1 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rpusd2Q149F1 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rpusd2Q149F1 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rpusd2Q149F1 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rpusd2Q149F1 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rpusd2Q149F1 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rpusd2Q149F1 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rpusd2Q149F1 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rpusd2Q149F1 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Rpusd2Q149F1 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Rpusd2Q149F1 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rpusd2Q149F1 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rpusd2Q149F1 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rpusd2Q149F1 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rpusd2Q149F1 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rpusd2Q149F1 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rpusd2Q149F1 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rpusd2Q149F1 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Rpusd2Q149F1 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rpusd2Q149F1 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Rpusd2Q149F1 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rpusd2Q149F1 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rpusd2Q149F1 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rpusd2Q149F1 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rpusd2Q149F1 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rpusd2Q149F1 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rpusd2Q149F1 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rpusd2Q149F1 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rpusd2Q149F1 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rpusd2Q149F1 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rpusd2Q149F1 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rpusd2Q149F1 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rpusd2Q149F1 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rpusd2Q149F1 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rpusd2Q149F1 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rpusd2Q149F1 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rpusd2Q149F1 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Rpusd2Q149F1 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rpusd2Q149F1 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rpusd2Q149F1 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Rpusd2Q149F1 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rpusd2Q149F1 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rpusd2Q149F1 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rpusd2Q149F1 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rpusd2Q149F1 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rpusd2Q149F1 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rpusd2Q149F1 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rpusd2Q149F1 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Rpusd2Q149F1 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rpusd2Q149F1 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rpusd2Q149F1 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
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