Protein–RNA interactions for Protein: Q148W0

Atp8b1, Phospholipid-transporting ATPase IC, mousemouse

Predictions only

Length 1,251 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp8b1Q148W0 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Atp8b1Q148W0 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Atp8b1Q148W0 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Atp8b1Q148W0 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Atp8b1Q148W0 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Atp8b1Q148W0 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Atp8b1Q148W0 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Atp8b1Q148W0 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Atp8b1Q148W0 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Atp8b1Q148W0 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atp8b1Q148W0 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atp8b1Q148W0 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atp8b1Q148W0 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atp8b1Q148W0 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atp8b1Q148W0 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atp8b1Q148W0 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atp8b1Q148W0 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atp8b1Q148W0 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atp8b1Q148W0 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atp8b1Q148W0 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atp8b1Q148W0 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atp8b1Q148W0 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atp8b1Q148W0 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Atp8b1Q148W0 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Atp8b1Q148W0 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atp8b1Q148W0 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atp8b1Q148W0 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atp8b1Q148W0 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Atp8b1Q148W0 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atp8b1Q148W0 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atp8b1Q148W0 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atp8b1Q148W0 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Atp8b1Q148W0 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Atp8b1Q148W0 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Atp8b1Q148W0 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Atp8b1Q148W0 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Atp8b1Q148W0 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Atp8b1Q148W0 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Atp8b1Q148W0 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Atp8b1Q148W0 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Atp8b1Q148W0 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Atp8b1Q148W0 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Atp8b1Q148W0 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Atp8b1Q148W0 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Atp8b1Q148W0 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Atp8b1Q148W0 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Atp8b1Q148W0 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Atp8b1Q148W0 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Atp8b1Q148W0 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Atp8b1Q148W0 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Atp8b1Q148W0 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Atp8b1Q148W0 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Atp8b1Q148W0 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Atp8b1Q148W0 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Atp8b1Q148W0 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Atp8b1Q148W0 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Atp8b1Q148W0 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Atp8b1Q148W0 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Atp8b1Q148W0 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Atp8b1Q148W0 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atp8b1Q148W0 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atp8b1Q148W0 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atp8b1Q148W0 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atp8b1Q148W0 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atp8b1Q148W0 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atp8b1Q148W0 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atp8b1Q148W0 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atp8b1Q148W0 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Atp8b1Q148W0 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atp8b1Q148W0 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atp8b1Q148W0 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atp8b1Q148W0 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atp8b1Q148W0 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atp8b1Q148W0 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atp8b1Q148W0 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atp8b1Q148W0 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atp8b1Q148W0 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atp8b1Q148W0 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atp8b1Q148W0 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atp8b1Q148W0 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atp8b1Q148W0 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atp8b1Q148W0 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atp8b1Q148W0 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atp8b1Q148W0 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atp8b1Q148W0 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atp8b1Q148W0 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atp8b1Q148W0 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atp8b1Q148W0 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atp8b1Q148W0 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atp8b1Q148W0 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atp8b1Q148W0 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atp8b1Q148W0 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atp8b1Q148W0 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atp8b1Q148W0 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atp8b1Q148W0 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atp8b1Q148W0 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atp8b1Q148W0 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atp8b1Q148W0 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atp8b1Q148W0 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atp8b1Q148W0 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.9 ms