Protein–RNA interactions for Protein: Q11136

Pepd, Xaa-Pro dipeptidase, mousemouse

Predictions only

Length 493 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PepdQ11136 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
PepdQ11136 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PepdQ11136 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PepdQ11136 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PepdQ11136 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PepdQ11136 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PepdQ11136 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PepdQ11136 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PepdQ11136 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PepdQ11136 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PepdQ11136 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PepdQ11136 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PepdQ11136 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PepdQ11136 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PepdQ11136 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PepdQ11136 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PepdQ11136 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
PepdQ11136 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PepdQ11136 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PepdQ11136 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PepdQ11136 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PepdQ11136 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PepdQ11136 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PepdQ11136 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PepdQ11136 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PepdQ11136 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PepdQ11136 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PepdQ11136 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PepdQ11136 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PepdQ11136 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PepdQ11136 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PepdQ11136 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PepdQ11136 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PepdQ11136 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PepdQ11136 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PepdQ11136 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PepdQ11136 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
PepdQ11136 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
PepdQ11136 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
PepdQ11136 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PepdQ11136 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PepdQ11136 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PepdQ11136 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PepdQ11136 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PepdQ11136 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PepdQ11136 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PepdQ11136 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PepdQ11136 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PepdQ11136 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PepdQ11136 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PepdQ11136 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PepdQ11136 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PepdQ11136 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PepdQ11136 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PepdQ11136 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PepdQ11136 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PepdQ11136 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PepdQ11136 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
PepdQ11136 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PepdQ11136 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
PepdQ11136 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PepdQ11136 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
PepdQ11136 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PepdQ11136 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PepdQ11136 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PepdQ11136 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PepdQ11136 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PepdQ11136 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PepdQ11136 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PepdQ11136 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PepdQ11136 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PepdQ11136 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PepdQ11136 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PepdQ11136 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PepdQ11136 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PepdQ11136 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PepdQ11136 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PepdQ11136 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PepdQ11136 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PepdQ11136 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PepdQ11136 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PepdQ11136 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PepdQ11136 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PepdQ11136 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
PepdQ11136 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PepdQ11136 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PepdQ11136 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PepdQ11136 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PepdQ11136 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PepdQ11136 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PepdQ11136 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PepdQ11136 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PepdQ11136 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PepdQ11136 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PepdQ11136 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PepdQ11136 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PepdQ11136 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PepdQ11136 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PepdQ11136 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PepdQ11136 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms