Protein–RNA interactions for Protein: Q0VGT2

Gli2, Zinc finger protein GLI2, mousemouse

Predictions only

Length 1,544 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gli2Q0VGT2 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Gli2Q0VGT2 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Gli2Q0VGT2 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Gli2Q0VGT2 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Gli2Q0VGT2 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Gli2Q0VGT2 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Gli2Q0VGT2 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Gli2Q0VGT2 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Gli2Q0VGT2 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Gli2Q0VGT2 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Gli2Q0VGT2 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Gli2Q0VGT2 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Gli2Q0VGT2 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Gli2Q0VGT2 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Gli2Q0VGT2 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Gli2Q0VGT2 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Gli2Q0VGT2 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Gli2Q0VGT2 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Gli2Q0VGT2 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Gli2Q0VGT2 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Gli2Q0VGT2 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Gli2Q0VGT2 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Gli2Q0VGT2 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Gli2Q0VGT2 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Gli2Q0VGT2 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Gli2Q0VGT2 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Gli2Q0VGT2 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Gli2Q0VGT2 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Gli2Q0VGT2 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Gli2Q0VGT2 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Gli2Q0VGT2 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Gli2Q0VGT2 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Gli2Q0VGT2 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Gli2Q0VGT2 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Gli2Q0VGT2 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Gli2Q0VGT2 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Gli2Q0VGT2 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Gli2Q0VGT2 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Gli2Q0VGT2 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Gli2Q0VGT2 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Gli2Q0VGT2 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Gli2Q0VGT2 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Gli2Q0VGT2 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Gli2Q0VGT2 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Gli2Q0VGT2 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Gli2Q0VGT2 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Gli2Q0VGT2 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Gli2Q0VGT2 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Gli2Q0VGT2 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Gli2Q0VGT2 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Gli2Q0VGT2 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Gli2Q0VGT2 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Gli2Q0VGT2 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Gli2Q0VGT2 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Gli2Q0VGT2 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Gli2Q0VGT2 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Gli2Q0VGT2 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Gli2Q0VGT2 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Gli2Q0VGT2 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Gli2Q0VGT2 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Gli2Q0VGT2 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Gli2Q0VGT2 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Gli2Q0VGT2 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Gli2Q0VGT2 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Gli2Q0VGT2 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Gli2Q0VGT2 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Gli2Q0VGT2 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Gli2Q0VGT2 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Gli2Q0VGT2 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Gli2Q0VGT2 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Gli2Q0VGT2 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Gli2Q0VGT2 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Gli2Q0VGT2 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Gli2Q0VGT2 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Gli2Q0VGT2 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Gli2Q0VGT2 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Gli2Q0VGT2 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Gli2Q0VGT2 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Gli2Q0VGT2 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Gli2Q0VGT2 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Gli2Q0VGT2 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Gli2Q0VGT2 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Gli2Q0VGT2 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Gli2Q0VGT2 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Gli2Q0VGT2 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Gli2Q0VGT2 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Gli2Q0VGT2 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Gli2Q0VGT2 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Gli2Q0VGT2 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Gli2Q0VGT2 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Gli2Q0VGT2 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Gli2Q0VGT2 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Gli2Q0VGT2 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Gli2Q0VGT2 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Gli2Q0VGT2 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Gli2Q0VGT2 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Gli2Q0VGT2 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Gli2Q0VGT2 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Gli2Q0VGT2 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Gli2Q0VGT2 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms