Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF76

Ttc39d, Tetratricopeptide repeat domain 39D, mousemouse

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Length 604 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc39dQ0VF76 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ttc39dQ0VF76 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ttc39dQ0VF76 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ttc39dQ0VF76 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ttc39dQ0VF76 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ttc39dQ0VF76 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ttc39dQ0VF76 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ttc39dQ0VF76 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ttc39dQ0VF76 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ttc39dQ0VF76 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ttc39dQ0VF76 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ttc39dQ0VF76 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ttc39dQ0VF76 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ttc39dQ0VF76 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ttc39dQ0VF76 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ttc39dQ0VF76 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ttc39dQ0VF76 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ttc39dQ0VF76 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ttc39dQ0VF76 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ttc39dQ0VF76 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ttc39dQ0VF76 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ttc39dQ0VF76 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ttc39dQ0VF76 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ttc39dQ0VF76 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ttc39dQ0VF76 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ttc39dQ0VF76 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ttc39dQ0VF76 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ttc39dQ0VF76 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ttc39dQ0VF76 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ttc39dQ0VF76 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ttc39dQ0VF76 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ttc39dQ0VF76 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ttc39dQ0VF76 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ttc39dQ0VF76 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ttc39dQ0VF76 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Ttc39dQ0VF76 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ttc39dQ0VF76 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ttc39dQ0VF76 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ttc39dQ0VF76 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ttc39dQ0VF76 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ttc39dQ0VF76 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ttc39dQ0VF76 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ttc39dQ0VF76 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ttc39dQ0VF76 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ttc39dQ0VF76 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ttc39dQ0VF76 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ttc39dQ0VF76 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ttc39dQ0VF76 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ttc39dQ0VF76 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ttc39dQ0VF76 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ttc39dQ0VF76 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ttc39dQ0VF76 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ttc39dQ0VF76 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ttc39dQ0VF76 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ttc39dQ0VF76 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ttc39dQ0VF76 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ttc39dQ0VF76 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ttc39dQ0VF76 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ttc39dQ0VF76 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ttc39dQ0VF76 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ttc39dQ0VF76 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ttc39dQ0VF76 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Ttc39dQ0VF76 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Ttc39dQ0VF76 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ttc39dQ0VF76 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Ttc39dQ0VF76 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ttc39dQ0VF76 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ttc39dQ0VF76 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Ttc39dQ0VF76 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ttc39dQ0VF76 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Ttc39dQ0VF76 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ttc39dQ0VF76 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ttc39dQ0VF76 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ttc39dQ0VF76 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ttc39dQ0VF76 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ttc39dQ0VF76 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ttc39dQ0VF76 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ttc39dQ0VF76 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ttc39dQ0VF76 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ttc39dQ0VF76 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ttc39dQ0VF76 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ttc39dQ0VF76 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ttc39dQ0VF76 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ttc39dQ0VF76 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ttc39dQ0VF76 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ttc39dQ0VF76 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ttc39dQ0VF76 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ttc39dQ0VF76 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ttc39dQ0VF76 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Ttc39dQ0VF76 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ttc39dQ0VF76 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ttc39dQ0VF76 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ttc39dQ0VF76 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ttc39dQ0VF76 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ttc39dQ0VF76 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ttc39dQ0VF76 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ttc39dQ0VF76 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ttc39dQ0VF76 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ttc39dQ0VF76 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ttc39dQ0VF76 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms