Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF55

Atp2b3, Calcium-transporting ATPase, mousemouse

Predictions only

Length 1,220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp2b3Q0VF55 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Atp2b3Q0VF55 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Atp2b3Q0VF55 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Atp2b3Q0VF55 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Atp2b3Q0VF55 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Atp2b3Q0VF55 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Atp2b3Q0VF55 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Atp2b3Q0VF55 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Atp2b3Q0VF55 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Atp2b3Q0VF55 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Atp2b3Q0VF55 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Atp2b3Q0VF55 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Atp2b3Q0VF55 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Atp2b3Q0VF55 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Atp2b3Q0VF55 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Atp2b3Q0VF55 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Atp2b3Q0VF55 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Atp2b3Q0VF55 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Atp2b3Q0VF55 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Atp2b3Q0VF55 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Atp2b3Q0VF55 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Atp2b3Q0VF55 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Atp2b3Q0VF55 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Atp2b3Q0VF55 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Atp2b3Q0VF55 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Atp2b3Q0VF55 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Atp2b3Q0VF55 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Atp2b3Q0VF55 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Atp2b3Q0VF55 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Atp2b3Q0VF55 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Atp2b3Q0VF55 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Atp2b3Q0VF55 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Atp2b3Q0VF55 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Atp2b3Q0VF55 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Atp2b3Q0VF55 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Atp2b3Q0VF55 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Atp2b3Q0VF55 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Atp2b3Q0VF55 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Atp2b3Q0VF55 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Atp2b3Q0VF55 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Atp2b3Q0VF55 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Atp2b3Q0VF55 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Atp2b3Q0VF55 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Atp2b3Q0VF55 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Atp2b3Q0VF55 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Atp2b3Q0VF55 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Atp2b3Q0VF55 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Atp2b3Q0VF55 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Atp2b3Q0VF55 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Atp2b3Q0VF55 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Atp2b3Q0VF55 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Atp2b3Q0VF55 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Atp2b3Q0VF55 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Atp2b3Q0VF55 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Atp2b3Q0VF55 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Atp2b3Q0VF55 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Atp2b3Q0VF55 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Atp2b3Q0VF55 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Atp2b3Q0VF55 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Atp2b3Q0VF55 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Atp2b3Q0VF55 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Atp2b3Q0VF55 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Atp2b3Q0VF55 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Atp2b3Q0VF55 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Atp2b3Q0VF55 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Atp2b3Q0VF55 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Atp2b3Q0VF55 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Atp2b3Q0VF55 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Atp2b3Q0VF55 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Atp2b3Q0VF55 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Atp2b3Q0VF55 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Atp2b3Q0VF55 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Atp2b3Q0VF55 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Atp2b3Q0VF55 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Atp2b3Q0VF55 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Atp2b3Q0VF55 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Atp2b3Q0VF55 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Atp2b3Q0VF55 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Atp2b3Q0VF55 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Atp2b3Q0VF55 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Atp2b3Q0VF55 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Atp2b3Q0VF55 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Atp2b3Q0VF55 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Atp2b3Q0VF55 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Atp2b3Q0VF55 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Atp2b3Q0VF55 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Atp2b3Q0VF55 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Atp2b3Q0VF55 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Atp2b3Q0VF55 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Atp2b3Q0VF55 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Atp2b3Q0VF55 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Atp2b3Q0VF55 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Atp2b3Q0VF55 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Atp2b3Q0VF55 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Atp2b3Q0VF55 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Atp2b3Q0VF55 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Atp2b3Q0VF55 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Atp2b3Q0VF55 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Atp2b3Q0VF55 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Atp2b3Q0VF55 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms