Protein–RNA interactions for Protein: Q0VDN7

Rundc1, RUN domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rundc1Q0VDN7 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rundc1Q0VDN7 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rundc1Q0VDN7 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rundc1Q0VDN7 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rundc1Q0VDN7 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rundc1Q0VDN7 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rundc1Q0VDN7 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rundc1Q0VDN7 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rundc1Q0VDN7 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Rundc1Q0VDN7 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rundc1Q0VDN7 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Rundc1Q0VDN7 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rundc1Q0VDN7 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rundc1Q0VDN7 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rundc1Q0VDN7 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rundc1Q0VDN7 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rundc1Q0VDN7 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Rundc1Q0VDN7 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rundc1Q0VDN7 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Rundc1Q0VDN7 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Rundc1Q0VDN7 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rundc1Q0VDN7 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rundc1Q0VDN7 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rundc1Q0VDN7 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rundc1Q0VDN7 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rundc1Q0VDN7 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rundc1Q0VDN7 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rundc1Q0VDN7 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rundc1Q0VDN7 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Rundc1Q0VDN7 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Rundc1Q0VDN7 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rundc1Q0VDN7 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rundc1Q0VDN7 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rundc1Q0VDN7 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rundc1Q0VDN7 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rundc1Q0VDN7 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rundc1Q0VDN7 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rundc1Q0VDN7 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rundc1Q0VDN7 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rundc1Q0VDN7 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rundc1Q0VDN7 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rundc1Q0VDN7 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rundc1Q0VDN7 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rundc1Q0VDN7 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rundc1Q0VDN7 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rundc1Q0VDN7 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rundc1Q0VDN7 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rundc1Q0VDN7 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rundc1Q0VDN7 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rundc1Q0VDN7 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rundc1Q0VDN7 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rundc1Q0VDN7 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rundc1Q0VDN7 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rundc1Q0VDN7 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rundc1Q0VDN7 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rundc1Q0VDN7 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rundc1Q0VDN7 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rundc1Q0VDN7 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rundc1Q0VDN7 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rundc1Q0VDN7 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rundc1Q0VDN7 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rundc1Q0VDN7 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rundc1Q0VDN7 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rundc1Q0VDN7 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rundc1Q0VDN7 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Rundc1Q0VDN7 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rundc1Q0VDN7 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rundc1Q0VDN7 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rundc1Q0VDN7 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rundc1Q0VDN7 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rundc1Q0VDN7 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rundc1Q0VDN7 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rundc1Q0VDN7 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rundc1Q0VDN7 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rundc1Q0VDN7 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rundc1Q0VDN7 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Rundc1Q0VDN7 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rundc1Q0VDN7 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rundc1Q0VDN7 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rundc1Q0VDN7 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rundc1Q0VDN7 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rundc1Q0VDN7 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Rundc1Q0VDN7 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Rundc1Q0VDN7 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Rundc1Q0VDN7 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Rundc1Q0VDN7 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Rundc1Q0VDN7 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Rundc1Q0VDN7 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Rundc1Q0VDN7 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Rundc1Q0VDN7 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Rundc1Q0VDN7 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Rundc1Q0VDN7 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Rundc1Q0VDN7 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Rundc1Q0VDN7 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Rundc1Q0VDN7 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Rundc1Q0VDN7 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rundc1Q0VDN7 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rundc1Q0VDN7 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rundc1Q0VDN7 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rundc1Q0VDN7 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms