Protein–RNA interactions for Protein: Q0P5X1

Lrriq1, Leucine-rich repeat and IQ domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,673 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrriq1Q0P5X1 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Lrriq1Q0P5X1 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Lrriq1Q0P5X1 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Lrriq1Q0P5X1 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Lrriq1Q0P5X1 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Lrriq1Q0P5X1 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Lrriq1Q0P5X1 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Lrriq1Q0P5X1 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Lrriq1Q0P5X1 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Lrriq1Q0P5X1 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Lrriq1Q0P5X1 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Lrriq1Q0P5X1 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Lrriq1Q0P5X1 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Lrriq1Q0P5X1 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Lrriq1Q0P5X1 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Lrriq1Q0P5X1 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Lrriq1Q0P5X1 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Lrriq1Q0P5X1 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Lrriq1Q0P5X1 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Lrriq1Q0P5X1 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Lrriq1Q0P5X1 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Lrriq1Q0P5X1 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Lrriq1Q0P5X1 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Lrriq1Q0P5X1 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Lrriq1Q0P5X1 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Lrriq1Q0P5X1 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Lrriq1Q0P5X1 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Lrriq1Q0P5X1 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
Lrriq1Q0P5X1 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Lrriq1Q0P5X1 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Lrriq1Q0P5X1 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Lrriq1Q0P5X1 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Lrriq1Q0P5X1 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Lrriq1Q0P5X1 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Lrriq1Q0P5X1 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
Lrriq1Q0P5X1 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Lrriq1Q0P5X1 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Lrriq1Q0P5X1 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Lrriq1Q0P5X1 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
Lrriq1Q0P5X1 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Lrriq1Q0P5X1 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Lrriq1Q0P5X1 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Lrriq1Q0P5X1 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Lrriq1Q0P5X1 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Lrriq1Q0P5X1 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
Lrriq1Q0P5X1 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Lrriq1Q0P5X1 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Lrriq1Q0P5X1 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Lrriq1Q0P5X1 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Lrriq1Q0P5X1 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Lrriq1Q0P5X1 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
Lrriq1Q0P5X1 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Lrriq1Q0P5X1 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Lrriq1Q0P5X1 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Lrriq1Q0P5X1 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Lrriq1Q0P5X1 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Lrriq1Q0P5X1 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Lrriq1Q0P5X1 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Lrriq1Q0P5X1 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
Lrriq1Q0P5X1 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Lrriq1Q0P5X1 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Lrriq1Q0P5X1 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Lrriq1Q0P5X1 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Lrriq1Q0P5X1 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
Lrriq1Q0P5X1 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Lrriq1Q0P5X1 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Lrriq1Q0P5X1 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Lrriq1Q0P5X1 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Lrriq1Q0P5X1 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Lrriq1Q0P5X1 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Lrriq1Q0P5X1 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Lrriq1Q0P5X1 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Lrriq1Q0P5X1 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Lrriq1Q0P5X1 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Lrriq1Q0P5X1 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
Lrriq1Q0P5X1 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
Lrriq1Q0P5X1 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Lrriq1Q0P5X1 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
Lrriq1Q0P5X1 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Lrriq1Q0P5X1 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Lrriq1Q0P5X1 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Lrriq1Q0P5X1 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Lrriq1Q0P5X1 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Lrriq1Q0P5X1 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Lrriq1Q0P5X1 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Lrriq1Q0P5X1 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Lrriq1Q0P5X1 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Lrriq1Q0P5X1 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Lrriq1Q0P5X1 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Lrriq1Q0P5X1 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Lrriq1Q0P5X1 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Lrriq1Q0P5X1 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Lrriq1Q0P5X1 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Lrriq1Q0P5X1 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Lrriq1Q0P5X1 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Lrriq1Q0P5X1 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Lrriq1Q0P5X1 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Lrriq1Q0P5X1 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Lrriq1Q0P5X1 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Lrriq1Q0P5X1 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.4 ms