Protein–RNA interactions for Protein: Q0P557

Spata18, Mitochondria-eating protein, mousemouse

Predictions only

Length 537 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spata18Q0P557 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Spata18Q0P557 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Spata18Q0P557 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Spata18Q0P557 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Spata18Q0P557 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Spata18Q0P557 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Spata18Q0P557 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Spata18Q0P557 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Spata18Q0P557 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Spata18Q0P557 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Spata18Q0P557 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Spata18Q0P557 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Spata18Q0P557 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Spata18Q0P557 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Spata18Q0P557 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Spata18Q0P557 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Spata18Q0P557 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Spata18Q0P557 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Spata18Q0P557 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Spata18Q0P557 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Spata18Q0P557 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Spata18Q0P557 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Spata18Q0P557 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Spata18Q0P557 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Spata18Q0P557 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Spata18Q0P557 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Spata18Q0P557 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Spata18Q0P557 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Spata18Q0P557 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Spata18Q0P557 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Spata18Q0P557 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Spata18Q0P557 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Spata18Q0P557 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Spata18Q0P557 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Spata18Q0P557 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Spata18Q0P557 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Spata18Q0P557 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Spata18Q0P557 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Spata18Q0P557 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Spata18Q0P557 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Spata18Q0P557 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Spata18Q0P557 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Spata18Q0P557 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Spata18Q0P557 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Spata18Q0P557 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Spata18Q0P557 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Spata18Q0P557 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Spata18Q0P557 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Spata18Q0P557 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Spata18Q0P557 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Spata18Q0P557 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Spata18Q0P557 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Spata18Q0P557 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Spata18Q0P557 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Spata18Q0P557 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Spata18Q0P557 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Spata18Q0P557 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Spata18Q0P557 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Spata18Q0P557 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Spata18Q0P557 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Spata18Q0P557 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Spata18Q0P557 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Spata18Q0P557 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Spata18Q0P557 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Spata18Q0P557 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Spata18Q0P557 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Spata18Q0P557 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Spata18Q0P557 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Spata18Q0P557 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Spata18Q0P557 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Spata18Q0P557 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Spata18Q0P557 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Spata18Q0P557 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Spata18Q0P557 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Spata18Q0P557 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Spata18Q0P557 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Spata18Q0P557 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Spata18Q0P557 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Spata18Q0P557 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Spata18Q0P557 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Spata18Q0P557 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Spata18Q0P557 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Spata18Q0P557 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Spata18Q0P557 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Spata18Q0P557 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Spata18Q0P557 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Spata18Q0P557 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Spata18Q0P557 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Spata18Q0P557 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Spata18Q0P557 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Spata18Q0P557 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Spata18Q0P557 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Spata18Q0P557 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Spata18Q0P557 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Spata18Q0P557 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Spata18Q0P557 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Spata18Q0P557 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Spata18Q0P557 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Spata18Q0P557 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Spata18Q0P557 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms