Protein–RNA interactions for Protein: Q0GGX2

Znf541, Zinc finger protein 541, mousemouse

Predictions only

Length 1,363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf541Q0GGX2 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Znf541Q0GGX2 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Znf541Q0GGX2 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Znf541Q0GGX2 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Znf541Q0GGX2 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Znf541Q0GGX2 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Znf541Q0GGX2 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Znf541Q0GGX2 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Znf541Q0GGX2 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Znf541Q0GGX2 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Znf541Q0GGX2 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Znf541Q0GGX2 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Znf541Q0GGX2 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Znf541Q0GGX2 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Znf541Q0GGX2 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Znf541Q0GGX2 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Znf541Q0GGX2 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Znf541Q0GGX2 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Znf541Q0GGX2 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Znf541Q0GGX2 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Znf541Q0GGX2 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Znf541Q0GGX2 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Znf541Q0GGX2 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Znf541Q0GGX2 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Znf541Q0GGX2 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Znf541Q0GGX2 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Znf541Q0GGX2 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Znf541Q0GGX2 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Znf541Q0GGX2 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Znf541Q0GGX2 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Znf541Q0GGX2 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Znf541Q0GGX2 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Znf541Q0GGX2 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Znf541Q0GGX2 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Znf541Q0GGX2 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Znf541Q0GGX2 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Znf541Q0GGX2 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Znf541Q0GGX2 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Znf541Q0GGX2 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Znf541Q0GGX2 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Znf541Q0GGX2 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Znf541Q0GGX2 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Znf541Q0GGX2 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Znf541Q0GGX2 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Znf541Q0GGX2 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Znf541Q0GGX2 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Znf541Q0GGX2 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Znf541Q0GGX2 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Znf541Q0GGX2 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Znf541Q0GGX2 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Znf541Q0GGX2 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Znf541Q0GGX2 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Znf541Q0GGX2 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Znf541Q0GGX2 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Znf541Q0GGX2 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Znf541Q0GGX2 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Znf541Q0GGX2 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Znf541Q0GGX2 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Znf541Q0GGX2 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Znf541Q0GGX2 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Znf541Q0GGX2 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Znf541Q0GGX2 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Znf541Q0GGX2 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Znf541Q0GGX2 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Znf541Q0GGX2 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Znf541Q0GGX2 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Znf541Q0GGX2 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Znf541Q0GGX2 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Znf541Q0GGX2 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Znf541Q0GGX2 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Znf541Q0GGX2 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Znf541Q0GGX2 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Znf541Q0GGX2 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Znf541Q0GGX2 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Znf541Q0GGX2 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Znf541Q0GGX2 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Znf541Q0GGX2 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Znf541Q0GGX2 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Znf541Q0GGX2 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Znf541Q0GGX2 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Znf541Q0GGX2 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Znf541Q0GGX2 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Znf541Q0GGX2 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Znf541Q0GGX2 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Znf541Q0GGX2 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Znf541Q0GGX2 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Znf541Q0GGX2 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Znf541Q0GGX2 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Znf541Q0GGX2 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Znf541Q0GGX2 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Znf541Q0GGX2 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Znf541Q0GGX2 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Znf541Q0GGX2 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Znf541Q0GGX2 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Znf541Q0GGX2 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Znf541Q0GGX2 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Znf541Q0GGX2 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Znf541Q0GGX2 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Znf541Q0GGX2 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Znf541Q0GGX2 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.1 ms