Protein–RNA interactions for Protein: Q08EC4

Cass4, Cas scaffolding protein family member 4, mousemouse

Predictions only

Length 804 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cass4Q08EC4 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cass4Q08EC4 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cass4Q08EC4 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cass4Q08EC4 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cass4Q08EC4 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Cass4Q08EC4 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cass4Q08EC4 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cass4Q08EC4 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cass4Q08EC4 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cass4Q08EC4 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cass4Q08EC4 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cass4Q08EC4 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cass4Q08EC4 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cass4Q08EC4 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cass4Q08EC4 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cass4Q08EC4 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cass4Q08EC4 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cass4Q08EC4 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cass4Q08EC4 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cass4Q08EC4 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cass4Q08EC4 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cass4Q08EC4 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cass4Q08EC4 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cass4Q08EC4 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cass4Q08EC4 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cass4Q08EC4 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cass4Q08EC4 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cass4Q08EC4 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cass4Q08EC4 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cass4Q08EC4 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cass4Q08EC4 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cass4Q08EC4 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cass4Q08EC4 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cass4Q08EC4 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Cass4Q08EC4 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cass4Q08EC4 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cass4Q08EC4 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cass4Q08EC4 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cass4Q08EC4 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cass4Q08EC4 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cass4Q08EC4 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cass4Q08EC4 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cass4Q08EC4 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cass4Q08EC4 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Cass4Q08EC4 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cass4Q08EC4 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Cass4Q08EC4 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Cass4Q08EC4 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cass4Q08EC4 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cass4Q08EC4 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cass4Q08EC4 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cass4Q08EC4 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cass4Q08EC4 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cass4Q08EC4 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cass4Q08EC4 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cass4Q08EC4 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cass4Q08EC4 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cass4Q08EC4 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cass4Q08EC4 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cass4Q08EC4 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cass4Q08EC4 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cass4Q08EC4 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cass4Q08EC4 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cass4Q08EC4 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cass4Q08EC4 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cass4Q08EC4 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cass4Q08EC4 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cass4Q08EC4 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cass4Q08EC4 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cass4Q08EC4 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cass4Q08EC4 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cass4Q08EC4 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cass4Q08EC4 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cass4Q08EC4 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cass4Q08EC4 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cass4Q08EC4 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cass4Q08EC4 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cass4Q08EC4 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cass4Q08EC4 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cass4Q08EC4 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cass4Q08EC4 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cass4Q08EC4 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cass4Q08EC4 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cass4Q08EC4 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cass4Q08EC4 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cass4Q08EC4 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cass4Q08EC4 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cass4Q08EC4 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cass4Q08EC4 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cass4Q08EC4 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cass4Q08EC4 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cass4Q08EC4 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cass4Q08EC4 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Cass4Q08EC4 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cass4Q08EC4 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cass4Q08EC4 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Cass4Q08EC4 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cass4Q08EC4 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cass4Q08EC4 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cass4Q08EC4 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms