Protein–RNA interactions for Protein: Q08943

Ssrp1, FACT complex subunit SSRP1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssrp1Q08943 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ssrp1Q08943 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ssrp1Q08943 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ssrp1Q08943 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ssrp1Q08943 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ssrp1Q08943 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ssrp1Q08943 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ssrp1Q08943 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ssrp1Q08943 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Ssrp1Q08943 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ssrp1Q08943 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ssrp1Q08943 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ssrp1Q08943 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ssrp1Q08943 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ssrp1Q08943 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ssrp1Q08943 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Ssrp1Q08943 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ssrp1Q08943 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ssrp1Q08943 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ssrp1Q08943 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ssrp1Q08943 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ssrp1Q08943 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Ssrp1Q08943 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ssrp1Q08943 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ssrp1Q08943 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ssrp1Q08943 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ssrp1Q08943 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ssrp1Q08943 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ssrp1Q08943 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ssrp1Q08943 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ssrp1Q08943 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ssrp1Q08943 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ssrp1Q08943 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ssrp1Q08943 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ssrp1Q08943 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ssrp1Q08943 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ssrp1Q08943 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ssrp1Q08943 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ssrp1Q08943 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ssrp1Q08943 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ssrp1Q08943 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ssrp1Q08943 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ssrp1Q08943 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ssrp1Q08943 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ssrp1Q08943 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ssrp1Q08943 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ssrp1Q08943 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ssrp1Q08943 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ssrp1Q08943 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ssrp1Q08943 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ssrp1Q08943 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ssrp1Q08943 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Ssrp1Q08943 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ssrp1Q08943 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ssrp1Q08943 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ssrp1Q08943 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ssrp1Q08943 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ssrp1Q08943 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ssrp1Q08943 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ssrp1Q08943 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ssrp1Q08943 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ssrp1Q08943 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ssrp1Q08943 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ssrp1Q08943 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ssrp1Q08943 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Ssrp1Q08943 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ssrp1Q08943 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ssrp1Q08943 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ssrp1Q08943 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ssrp1Q08943 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ssrp1Q08943 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ssrp1Q08943 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ssrp1Q08943 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ssrp1Q08943 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ssrp1Q08943 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Ssrp1Q08943 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Ssrp1Q08943 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Ssrp1Q08943 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ssrp1Q08943 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Ssrp1Q08943 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ssrp1Q08943 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ssrp1Q08943 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ssrp1Q08943 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ssrp1Q08943 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ssrp1Q08943 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Ssrp1Q08943 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ssrp1Q08943 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ssrp1Q08943 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ssrp1Q08943 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ssrp1Q08943 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ssrp1Q08943 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ssrp1Q08943 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ssrp1Q08943 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ssrp1Q08943 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Ssrp1Q08943 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ssrp1Q08943 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ssrp1Q08943 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ssrp1Q08943 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Ssrp1Q08943 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Ssrp1Q08943 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms