Protein–RNA interactions for Protein: Q08535

Sct, Secretin, mousemouse

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SctQ08535 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SctQ08535 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SctQ08535 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SctQ08535 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SctQ08535 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SctQ08535 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SctQ08535 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SctQ08535 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SctQ08535 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SctQ08535 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SctQ08535 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SctQ08535 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SctQ08535 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SctQ08535 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SctQ08535 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SctQ08535 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SctQ08535 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SctQ08535 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SctQ08535 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SctQ08535 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SctQ08535 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SctQ08535 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
SctQ08535 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SctQ08535 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SctQ08535 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SctQ08535 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SctQ08535 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SctQ08535 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
SctQ08535 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
SctQ08535 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SctQ08535 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SctQ08535 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SctQ08535 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SctQ08535 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SctQ08535 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SctQ08535 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SctQ08535 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SctQ08535 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SctQ08535 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SctQ08535 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SctQ08535 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SctQ08535 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SctQ08535 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SctQ08535 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SctQ08535 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SctQ08535 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
SctQ08535 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
SctQ08535 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SctQ08535 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SctQ08535 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
SctQ08535 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SctQ08535 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SctQ08535 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SctQ08535 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SctQ08535 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SctQ08535 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SctQ08535 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SctQ08535 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
SctQ08535 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SctQ08535 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
SctQ08535 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SctQ08535 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SctQ08535 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SctQ08535 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SctQ08535 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SctQ08535 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SctQ08535 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SctQ08535 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SctQ08535 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SctQ08535 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SctQ08535 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SctQ08535 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SctQ08535 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SctQ08535 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SctQ08535 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SctQ08535 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SctQ08535 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SctQ08535 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SctQ08535 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SctQ08535 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SctQ08535 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SctQ08535 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SctQ08535 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SctQ08535 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SctQ08535 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SctQ08535 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SctQ08535 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SctQ08535 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
SctQ08535 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC16.46■□□□□ 0.22
SctQ08535 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
SctQ08535 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
SctQ08535 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
SctQ08535 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
SctQ08535 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SctQ08535 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SctQ08535 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SctQ08535 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SctQ08535 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SctQ08535 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SctQ08535 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms