Protein–RNA interactions for Protein: Q08460

Kcnma1, Calcium-activated potassium channel subunit alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnma1Q08460 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Kcnma1Q08460 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Kcnma1Q08460 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Kcnma1Q08460 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Kcnma1Q08460 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Kcnma1Q08460 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Kcnma1Q08460 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Kcnma1Q08460 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Kcnma1Q08460 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Kcnma1Q08460 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Kcnma1Q08460 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Kcnma1Q08460 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Kcnma1Q08460 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Kcnma1Q08460 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Kcnma1Q08460 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Kcnma1Q08460 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Kcnma1Q08460 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Kcnma1Q08460 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Kcnma1Q08460 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Kcnma1Q08460 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Kcnma1Q08460 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Kcnma1Q08460 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Kcnma1Q08460 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Kcnma1Q08460 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Kcnma1Q08460 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Kcnma1Q08460 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Kcnma1Q08460 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Kcnma1Q08460 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Kcnma1Q08460 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Kcnma1Q08460 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Kcnma1Q08460 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Kcnma1Q08460 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Kcnma1Q08460 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Kcnma1Q08460 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Kcnma1Q08460 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Kcnma1Q08460 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Kcnma1Q08460 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Kcnma1Q08460 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Kcnma1Q08460 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Kcnma1Q08460 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Kcnma1Q08460 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Kcnma1Q08460 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Kcnma1Q08460 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Kcnma1Q08460 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Kcnma1Q08460 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Kcnma1Q08460 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Kcnma1Q08460 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Kcnma1Q08460 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Kcnma1Q08460 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Kcnma1Q08460 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Kcnma1Q08460 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Kcnma1Q08460 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Kcnma1Q08460 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Kcnma1Q08460 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Kcnma1Q08460 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Kcnma1Q08460 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Kcnma1Q08460 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Kcnma1Q08460 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Kcnma1Q08460 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Kcnma1Q08460 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Kcnma1Q08460 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Kcnma1Q08460 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Kcnma1Q08460 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Kcnma1Q08460 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Kcnma1Q08460 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Kcnma1Q08460 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Kcnma1Q08460 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Kcnma1Q08460 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Kcnma1Q08460 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Kcnma1Q08460 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Kcnma1Q08460 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Kcnma1Q08460 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Kcnma1Q08460 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Kcnma1Q08460 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Kcnma1Q08460 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Kcnma1Q08460 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Kcnma1Q08460 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Kcnma1Q08460 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Kcnma1Q08460 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Kcnma1Q08460 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Kcnma1Q08460 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Kcnma1Q08460 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Kcnma1Q08460 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Kcnma1Q08460 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Kcnma1Q08460 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Kcnma1Q08460 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Kcnma1Q08460 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Kcnma1Q08460 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Kcnma1Q08460 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Kcnma1Q08460 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Kcnma1Q08460 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Kcnma1Q08460 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Kcnma1Q08460 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Kcnma1Q08460 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Kcnma1Q08460 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Kcnma1Q08460 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Kcnma1Q08460 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Kcnma1Q08460 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Kcnma1Q08460 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Kcnma1Q08460 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.5 ms