Protein–RNA interactions for Protein: Q08331

Calb2, Calretinin, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calb2Q08331 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Calb2Q08331 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Calb2Q08331 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Calb2Q08331 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Calb2Q08331 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Calb2Q08331 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Calb2Q08331 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Calb2Q08331 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Calb2Q08331 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Calb2Q08331 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Calb2Q08331 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Calb2Q08331 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Calb2Q08331 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Calb2Q08331 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Calb2Q08331 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Calb2Q08331 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Calb2Q08331 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Calb2Q08331 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Calb2Q08331 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Calb2Q08331 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Calb2Q08331 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Calb2Q08331 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Calb2Q08331 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Calb2Q08331 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Calb2Q08331 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Calb2Q08331 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Calb2Q08331 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Calb2Q08331 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Calb2Q08331 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Calb2Q08331 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Calb2Q08331 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Calb2Q08331 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Calb2Q08331 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Calb2Q08331 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Calb2Q08331 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Calb2Q08331 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Calb2Q08331 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Calb2Q08331 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Calb2Q08331 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Calb2Q08331 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Calb2Q08331 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Calb2Q08331 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Calb2Q08331 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Calb2Q08331 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Calb2Q08331 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Calb2Q08331 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Calb2Q08331 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Calb2Q08331 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Calb2Q08331 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Calb2Q08331 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Calb2Q08331 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Calb2Q08331 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Calb2Q08331 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Calb2Q08331 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Calb2Q08331 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Calb2Q08331 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Calb2Q08331 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Calb2Q08331 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Calb2Q08331 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Calb2Q08331 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Calb2Q08331 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Calb2Q08331 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Calb2Q08331 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Calb2Q08331 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Calb2Q08331 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Calb2Q08331 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Calb2Q08331 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Calb2Q08331 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Calb2Q08331 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Calb2Q08331 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Calb2Q08331 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Calb2Q08331 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Calb2Q08331 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Calb2Q08331 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Calb2Q08331 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Calb2Q08331 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Calb2Q08331 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Calb2Q08331 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Calb2Q08331 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Calb2Q08331 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Calb2Q08331 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Calb2Q08331 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Calb2Q08331 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Calb2Q08331 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Calb2Q08331 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Calb2Q08331 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Calb2Q08331 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Calb2Q08331 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Calb2Q08331 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Calb2Q08331 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Calb2Q08331 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Calb2Q08331 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Calb2Q08331 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Calb2Q08331 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Calb2Q08331 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Calb2Q08331 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Calb2Q08331 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Calb2Q08331 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Calb2Q08331 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Calb2Q08331 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms