Protein–RNA interactions for Protein: Q08189

Tgm3, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase E, mousemouse

Predictions only

Length 693 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgm3Q08189 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tgm3Q08189 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tgm3Q08189 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tgm3Q08189 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Tgm3Q08189 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tgm3Q08189 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tgm3Q08189 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tgm3Q08189 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tgm3Q08189 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tgm3Q08189 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tgm3Q08189 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tgm3Q08189 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tgm3Q08189 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tgm3Q08189 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tgm3Q08189 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tgm3Q08189 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tgm3Q08189 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tgm3Q08189 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tgm3Q08189 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tgm3Q08189 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tgm3Q08189 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tgm3Q08189 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Tgm3Q08189 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Tgm3Q08189 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tgm3Q08189 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tgm3Q08189 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tgm3Q08189 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tgm3Q08189 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tgm3Q08189 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tgm3Q08189 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tgm3Q08189 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tgm3Q08189 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tgm3Q08189 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tgm3Q08189 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tgm3Q08189 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tgm3Q08189 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tgm3Q08189 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tgm3Q08189 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tgm3Q08189 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tgm3Q08189 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tgm3Q08189 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tgm3Q08189 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tgm3Q08189 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Tgm3Q08189 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tgm3Q08189 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tgm3Q08189 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tgm3Q08189 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tgm3Q08189 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tgm3Q08189 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tgm3Q08189 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tgm3Q08189 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tgm3Q08189 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tgm3Q08189 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tgm3Q08189 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Tgm3Q08189 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tgm3Q08189 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tgm3Q08189 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tgm3Q08189 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tgm3Q08189 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Tgm3Q08189 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Tgm3Q08189 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Tgm3Q08189 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Tgm3Q08189 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Tgm3Q08189 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Tgm3Q08189 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tgm3Q08189 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tgm3Q08189 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tgm3Q08189 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tgm3Q08189 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tgm3Q08189 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tgm3Q08189 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tgm3Q08189 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Tgm3Q08189 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tgm3Q08189 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tgm3Q08189 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tgm3Q08189 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tgm3Q08189 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tgm3Q08189 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tgm3Q08189 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tgm3Q08189 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tgm3Q08189 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tgm3Q08189 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tgm3Q08189 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Tgm3Q08189 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tgm3Q08189 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Tgm3Q08189 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Tgm3Q08189 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Tgm3Q08189 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Tgm3Q08189 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Tgm3Q08189 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tgm3Q08189 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tgm3Q08189 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Tgm3Q08189 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Tgm3Q08189 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tgm3Q08189 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tgm3Q08189 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Tgm3Q08189 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tgm3Q08189 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tgm3Q08189 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tgm3Q08189 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms