Protein–RNA interactions for Protein: Q07563

Col17a1, Collagen alpha-1(XVII) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col17a1Q07563 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
Col17a1Q07563 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Col17a1Q07563 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Col17a1Q07563 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Col17a1Q07563 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Col17a1Q07563 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Col17a1Q07563 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
Col17a1Q07563 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Col17a1Q07563 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Col17a1Q07563 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Col17a1Q07563 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Col17a1Q07563 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Col17a1Q07563 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Col17a1Q07563 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Col17a1Q07563 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Col17a1Q07563 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Col17a1Q07563 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Col17a1Q07563 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC27■■□□□ 1.91
Col17a1Q07563 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC27■■□□□ 1.91
Col17a1Q07563 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Col17a1Q07563 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC27■■□□□ 1.91
Col17a1Q07563 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Col17a1Q07563 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Col17a1Q07563 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Col17a1Q07563 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
Col17a1Q07563 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC27■■□□□ 1.91
Col17a1Q07563 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Col17a1Q07563 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Col17a1Q07563 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC27■■□□□ 1.91
Col17a1Q07563 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC27■■□□□ 1.91
Col17a1Q07563 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Col17a1Q07563 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Col17a1Q07563 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Col17a1Q07563 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Col17a1Q07563 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Col17a1Q07563 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Col17a1Q07563 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Col17a1Q07563 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Col17a1Q07563 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Col17a1Q07563 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Col17a1Q07563 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Col17a1Q07563 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Col17a1Q07563 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Col17a1Q07563 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Col17a1Q07563 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Col17a1Q07563 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Col17a1Q07563 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Col17a1Q07563 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Col17a1Q07563 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Col17a1Q07563 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
Col17a1Q07563 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
Col17a1Q07563 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Col17a1Q07563 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
Col17a1Q07563 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Col17a1Q07563 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Col17a1Q07563 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Col17a1Q07563 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Col17a1Q07563 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Col17a1Q07563 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Col17a1Q07563 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Col17a1Q07563 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Col17a1Q07563 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Col17a1Q07563 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Col17a1Q07563 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Col17a1Q07563 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Col17a1Q07563 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Col17a1Q07563 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Col17a1Q07563 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
Col17a1Q07563 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Col17a1Q07563 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Col17a1Q07563 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Col17a1Q07563 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Col17a1Q07563 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Col17a1Q07563 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Col17a1Q07563 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Col17a1Q07563 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Col17a1Q07563 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Col17a1Q07563 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Col17a1Q07563 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Col17a1Q07563 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Col17a1Q07563 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Col17a1Q07563 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Col17a1Q07563 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Col17a1Q07563 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Col17a1Q07563 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Col17a1Q07563 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Col17a1Q07563 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Col17a1Q07563 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Col17a1Q07563 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
Col17a1Q07563 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Col17a1Q07563 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Col17a1Q07563 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Col17a1Q07563 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Col17a1Q07563 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Col17a1Q07563 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Col17a1Q07563 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Col17a1Q07563 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Col17a1Q07563 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Col17a1Q07563 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Col17a1Q07563 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.7 ms