Protein–RNA interactions for Protein: Q07475

Nrep, Neuronal regeneration-related protein, mousemouse

Predictions only

Length 68 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NrepQ07475 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
NrepQ07475 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
NrepQ07475 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
NrepQ07475 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
NrepQ07475 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
NrepQ07475 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
NrepQ07475 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
NrepQ07475 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
NrepQ07475 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
NrepQ07475 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
NrepQ07475 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
NrepQ07475 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
NrepQ07475 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
NrepQ07475 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
NrepQ07475 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
NrepQ07475 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
NrepQ07475 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
NrepQ07475 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
NrepQ07475 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
NrepQ07475 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
NrepQ07475 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
NrepQ07475 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
NrepQ07475 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
NrepQ07475 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
NrepQ07475 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
NrepQ07475 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
NrepQ07475 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
NrepQ07475 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
NrepQ07475 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
NrepQ07475 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
NrepQ07475 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
NrepQ07475 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
NrepQ07475 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
NrepQ07475 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
NrepQ07475 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
NrepQ07475 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
NrepQ07475 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
NrepQ07475 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
NrepQ07475 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
NrepQ07475 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
NrepQ07475 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
NrepQ07475 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
NrepQ07475 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
NrepQ07475 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
NrepQ07475 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
NrepQ07475 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
NrepQ07475 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
NrepQ07475 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
NrepQ07475 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
NrepQ07475 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
NrepQ07475 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
NrepQ07475 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
NrepQ07475 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
NrepQ07475 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
NrepQ07475 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
NrepQ07475 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
NrepQ07475 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
NrepQ07475 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
NrepQ07475 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
NrepQ07475 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
NrepQ07475 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
NrepQ07475 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
NrepQ07475 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
NrepQ07475 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
NrepQ07475 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
NrepQ07475 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
NrepQ07475 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
NrepQ07475 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
NrepQ07475 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
NrepQ07475 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
NrepQ07475 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
NrepQ07475 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
NrepQ07475 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
NrepQ07475 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
NrepQ07475 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
NrepQ07475 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC12.08□□□□□ -0.47
NrepQ07475 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC12.08□□□□□ -0.47
NrepQ07475 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
NrepQ07475 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
NrepQ07475 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
NrepQ07475 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
NrepQ07475 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
NrepQ07475 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
NrepQ07475 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
NrepQ07475 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
NrepQ07475 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC12.08□□□□□ -0.48
NrepQ07475 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
NrepQ07475 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC12.08□□□□□ -0.48
NrepQ07475 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
NrepQ07475 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
NrepQ07475 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
NrepQ07475 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
NrepQ07475 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
NrepQ07475 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC12.07□□□□□ -0.48
NrepQ07475 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
NrepQ07475 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
NrepQ07475 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
NrepQ07475 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
NrepQ07475 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
NrepQ07475 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.8 ms