Protein–RNA interactions for Protein: Q07456

Ambp, Protein AMBP, mousemouse

Predictions only

Length 349 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AmbpQ07456 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
AmbpQ07456 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
AmbpQ07456 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
AmbpQ07456 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
AmbpQ07456 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
AmbpQ07456 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
AmbpQ07456 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
AmbpQ07456 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC15.04■□□□□ -0
AmbpQ07456 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
AmbpQ07456 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
AmbpQ07456 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
AmbpQ07456 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC15.03■□□□□ -0
AmbpQ07456 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
AmbpQ07456 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
AmbpQ07456 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
AmbpQ07456 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
AmbpQ07456 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
AmbpQ07456 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
AmbpQ07456 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
AmbpQ07456 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
AmbpQ07456 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
AmbpQ07456 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
AmbpQ07456 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
AmbpQ07456 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
AmbpQ07456 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
AmbpQ07456 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
AmbpQ07456 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
AmbpQ07456 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
AmbpQ07456 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
AmbpQ07456 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
AmbpQ07456 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
AmbpQ07456 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
AmbpQ07456 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
AmbpQ07456 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
AmbpQ07456 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
AmbpQ07456 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
AmbpQ07456 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
AmbpQ07456 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
AmbpQ07456 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
AmbpQ07456 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
AmbpQ07456 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
AmbpQ07456 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
AmbpQ07456 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
AmbpQ07456 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC15.02■□□□□ -0
AmbpQ07456 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
AmbpQ07456 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
AmbpQ07456 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
AmbpQ07456 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
AmbpQ07456 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
AmbpQ07456 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
AmbpQ07456 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
AmbpQ07456 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
AmbpQ07456 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
AmbpQ07456 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
AmbpQ07456 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
AmbpQ07456 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
AmbpQ07456 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
AmbpQ07456 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
AmbpQ07456 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
AmbpQ07456 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
AmbpQ07456 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
AmbpQ07456 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
AmbpQ07456 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
AmbpQ07456 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
AmbpQ07456 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
AmbpQ07456 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
AmbpQ07456 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
AmbpQ07456 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
AmbpQ07456 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
AmbpQ07456 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
AmbpQ07456 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
AmbpQ07456 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
AmbpQ07456 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
AmbpQ07456 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
AmbpQ07456 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
AmbpQ07456 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
AmbpQ07456 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
AmbpQ07456 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
AmbpQ07456 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
AmbpQ07456 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
AmbpQ07456 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
AmbpQ07456 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
AmbpQ07456 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
AmbpQ07456 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
AmbpQ07456 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
AmbpQ07456 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
AmbpQ07456 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
AmbpQ07456 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
AmbpQ07456 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
AmbpQ07456 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
AmbpQ07456 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
AmbpQ07456 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
AmbpQ07456 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
AmbpQ07456 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
AmbpQ07456 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
AmbpQ07456 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
AmbpQ07456 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
AmbpQ07456 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
AmbpQ07456 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
AmbpQ07456 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms