Protein–RNA interactions for Protein: Q07105

Gdf9, Growth/differentiation factor 9, mousemouse

Predictions only

Length 441 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdf9Q07105 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gdf9Q07105 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gdf9Q07105 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gdf9Q07105 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gdf9Q07105 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gdf9Q07105 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gdf9Q07105 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gdf9Q07105 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gdf9Q07105 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gdf9Q07105 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gdf9Q07105 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gdf9Q07105 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gdf9Q07105 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gdf9Q07105 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gdf9Q07105 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gdf9Q07105 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gdf9Q07105 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gdf9Q07105 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gdf9Q07105 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gdf9Q07105 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Gdf9Q07105 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gdf9Q07105 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gdf9Q07105 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gdf9Q07105 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gdf9Q07105 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gdf9Q07105 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gdf9Q07105 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gdf9Q07105 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gdf9Q07105 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gdf9Q07105 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gdf9Q07105 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gdf9Q07105 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gdf9Q07105 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gdf9Q07105 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gdf9Q07105 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gdf9Q07105 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gdf9Q07105 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gdf9Q07105 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gdf9Q07105 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gdf9Q07105 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gdf9Q07105 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gdf9Q07105 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gdf9Q07105 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gdf9Q07105 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gdf9Q07105 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gdf9Q07105 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gdf9Q07105 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gdf9Q07105 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gdf9Q07105 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gdf9Q07105 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gdf9Q07105 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gdf9Q07105 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gdf9Q07105 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gdf9Q07105 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gdf9Q07105 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gdf9Q07105 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gdf9Q07105 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gdf9Q07105 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gdf9Q07105 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Gdf9Q07105 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gdf9Q07105 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gdf9Q07105 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gdf9Q07105 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gdf9Q07105 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gdf9Q07105 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gdf9Q07105 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gdf9Q07105 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gdf9Q07105 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gdf9Q07105 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Gdf9Q07105 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gdf9Q07105 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gdf9Q07105 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
Gdf9Q07105 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Gdf9Q07105 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Gdf9Q07105 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Gdf9Q07105 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Gdf9Q07105 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gdf9Q07105 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gdf9Q07105 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gdf9Q07105 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Gdf9Q07105 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gdf9Q07105 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gdf9Q07105 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gdf9Q07105 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gdf9Q07105 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gdf9Q07105 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Gdf9Q07105 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gdf9Q07105 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gdf9Q07105 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gdf9Q07105 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gdf9Q07105 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gdf9Q07105 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gdf9Q07105 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gdf9Q07105 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gdf9Q07105 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gdf9Q07105 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gdf9Q07105 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gdf9Q07105 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gdf9Q07105 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gdf9Q07105 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms