Protein–RNA interactions for Protein: Q06985

Siah1b, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH1B, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah1bQ06985 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Siah1bQ06985 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Siah1bQ06985 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Siah1bQ06985 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Siah1bQ06985 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Siah1bQ06985 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Siah1bQ06985 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Siah1bQ06985 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Siah1bQ06985 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Siah1bQ06985 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Siah1bQ06985 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Siah1bQ06985 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Siah1bQ06985 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Siah1bQ06985 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Siah1bQ06985 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Siah1bQ06985 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Siah1bQ06985 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Siah1bQ06985 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Siah1bQ06985 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Siah1bQ06985 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Siah1bQ06985 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Siah1bQ06985 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Siah1bQ06985 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Siah1bQ06985 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Siah1bQ06985 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Siah1bQ06985 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Siah1bQ06985 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Siah1bQ06985 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Siah1bQ06985 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Siah1bQ06985 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Siah1bQ06985 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Siah1bQ06985 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Siah1bQ06985 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Siah1bQ06985 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Siah1bQ06985 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Siah1bQ06985 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Siah1bQ06985 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Siah1bQ06985 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Siah1bQ06985 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Siah1bQ06985 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Siah1bQ06985 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Siah1bQ06985 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Siah1bQ06985 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Siah1bQ06985 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Siah1bQ06985 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Siah1bQ06985 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Siah1bQ06985 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Siah1bQ06985 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Siah1bQ06985 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
Siah1bQ06985 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Siah1bQ06985 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Siah1bQ06985 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Siah1bQ06985 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Siah1bQ06985 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Siah1bQ06985 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Siah1bQ06985 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Siah1bQ06985 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Siah1bQ06985 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Siah1bQ06985 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
Siah1bQ06985 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Siah1bQ06985 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Siah1bQ06985 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Siah1bQ06985 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Siah1bQ06985 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Siah1bQ06985 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Siah1bQ06985 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Siah1bQ06985 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Siah1bQ06985 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Siah1bQ06985 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Siah1bQ06985 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Siah1bQ06985 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Siah1bQ06985 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Siah1bQ06985 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Siah1bQ06985 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
Siah1bQ06985 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Siah1bQ06985 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Siah1bQ06985 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Siah1bQ06985 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Siah1bQ06985 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Siah1bQ06985 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Siah1bQ06985 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Siah1bQ06985 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Siah1bQ06985 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Siah1bQ06985 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Siah1bQ06985 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Siah1bQ06985 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Siah1bQ06985 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Siah1bQ06985 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Siah1bQ06985 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Siah1bQ06985 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Siah1bQ06985 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Siah1bQ06985 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Siah1bQ06985 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Siah1bQ06985 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Siah1bQ06985 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Siah1bQ06985 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Siah1bQ06985 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Siah1bQ06985 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Siah1bQ06985 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
Siah1bQ06985 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms