Protein–RNA interactions for Protein: Q05A80

Caprin2, Caprin-2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,031 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Caprin2Q05A80 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Caprin2Q05A80 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Caprin2Q05A80 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Caprin2Q05A80 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Caprin2Q05A80 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Caprin2Q05A80 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Caprin2Q05A80 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Caprin2Q05A80 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Caprin2Q05A80 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Caprin2Q05A80 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Caprin2Q05A80 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Caprin2Q05A80 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Caprin2Q05A80 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Caprin2Q05A80 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Caprin2Q05A80 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Caprin2Q05A80 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Caprin2Q05A80 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Caprin2Q05A80 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Caprin2Q05A80 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Caprin2Q05A80 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Caprin2Q05A80 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Caprin2Q05A80 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Caprin2Q05A80 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Caprin2Q05A80 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Caprin2Q05A80 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Caprin2Q05A80 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Caprin2Q05A80 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Caprin2Q05A80 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Caprin2Q05A80 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Caprin2Q05A80 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Caprin2Q05A80 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Caprin2Q05A80 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Caprin2Q05A80 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Caprin2Q05A80 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Caprin2Q05A80 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Caprin2Q05A80 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Caprin2Q05A80 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Caprin2Q05A80 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Caprin2Q05A80 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Caprin2Q05A80 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Caprin2Q05A80 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Caprin2Q05A80 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Caprin2Q05A80 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Caprin2Q05A80 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Caprin2Q05A80 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Caprin2Q05A80 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Caprin2Q05A80 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Caprin2Q05A80 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Caprin2Q05A80 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Caprin2Q05A80 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Caprin2Q05A80 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Caprin2Q05A80 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Caprin2Q05A80 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Caprin2Q05A80 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Caprin2Q05A80 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Caprin2Q05A80 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Caprin2Q05A80 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Caprin2Q05A80 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Caprin2Q05A80 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Caprin2Q05A80 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Caprin2Q05A80 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Caprin2Q05A80 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Caprin2Q05A80 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Caprin2Q05A80 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Caprin2Q05A80 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Caprin2Q05A80 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Caprin2Q05A80 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Caprin2Q05A80 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Caprin2Q05A80 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Caprin2Q05A80 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Caprin2Q05A80 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Caprin2Q05A80 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Caprin2Q05A80 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Caprin2Q05A80 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Caprin2Q05A80 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Caprin2Q05A80 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Caprin2Q05A80 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Caprin2Q05A80 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Caprin2Q05A80 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Caprin2Q05A80 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Caprin2Q05A80 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Caprin2Q05A80 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Caprin2Q05A80 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Caprin2Q05A80 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Caprin2Q05A80 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Caprin2Q05A80 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Caprin2Q05A80 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Caprin2Q05A80 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Caprin2Q05A80 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Caprin2Q05A80 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Caprin2Q05A80 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Caprin2Q05A80 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Caprin2Q05A80 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Caprin2Q05A80 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Caprin2Q05A80 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Caprin2Q05A80 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Caprin2Q05A80 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Caprin2Q05A80 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Caprin2Q05A80 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Caprin2Q05A80 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms