Protein–RNA interactions for Protein: Q05A62

Dnal1, Dynein light chain 1, axonemal, mousemouse

Predictions only

Length 190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnal1Q05A62 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Dnal1Q05A62 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Dnal1Q05A62 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Dnal1Q05A62 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Dnal1Q05A62 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Dnal1Q05A62 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Dnal1Q05A62 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Dnal1Q05A62 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Dnal1Q05A62 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Dnal1Q05A62 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Dnal1Q05A62 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Dnal1Q05A62 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Dnal1Q05A62 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Dnal1Q05A62 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Dnal1Q05A62 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Dnal1Q05A62 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Dnal1Q05A62 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Dnal1Q05A62 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Dnal1Q05A62 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Dnal1Q05A62 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Dnal1Q05A62 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Dnal1Q05A62 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Dnal1Q05A62 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Dnal1Q05A62 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Dnal1Q05A62 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Dnal1Q05A62 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Dnal1Q05A62 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Dnal1Q05A62 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Dnal1Q05A62 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Dnal1Q05A62 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Dnal1Q05A62 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Dnal1Q05A62 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Dnal1Q05A62 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Dnal1Q05A62 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Dnal1Q05A62 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Dnal1Q05A62 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Dnal1Q05A62 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Dnal1Q05A62 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Dnal1Q05A62 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Dnal1Q05A62 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Dnal1Q05A62 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Dnal1Q05A62 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Dnal1Q05A62 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Dnal1Q05A62 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Dnal1Q05A62 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Dnal1Q05A62 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Dnal1Q05A62 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Dnal1Q05A62 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Dnal1Q05A62 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Dnal1Q05A62 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Dnal1Q05A62 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Dnal1Q05A62 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Dnal1Q05A62 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Dnal1Q05A62 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Dnal1Q05A62 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Dnal1Q05A62 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Dnal1Q05A62 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Dnal1Q05A62 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Dnal1Q05A62 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Dnal1Q05A62 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Dnal1Q05A62 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Dnal1Q05A62 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Dnal1Q05A62 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Dnal1Q05A62 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Dnal1Q05A62 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Dnal1Q05A62 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Dnal1Q05A62 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Dnal1Q05A62 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Dnal1Q05A62 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Dnal1Q05A62 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Dnal1Q05A62 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Dnal1Q05A62 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Dnal1Q05A62 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Dnal1Q05A62 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Dnal1Q05A62 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Dnal1Q05A62 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Dnal1Q05A62 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Dnal1Q05A62 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Dnal1Q05A62 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Dnal1Q05A62 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Dnal1Q05A62 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Dnal1Q05A62 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Dnal1Q05A62 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Dnal1Q05A62 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Dnal1Q05A62 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Dnal1Q05A62 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Dnal1Q05A62 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Dnal1Q05A62 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Dnal1Q05A62 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Dnal1Q05A62 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Dnal1Q05A62 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Dnal1Q05A62 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Dnal1Q05A62 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Dnal1Q05A62 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Dnal1Q05A62 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Dnal1Q05A62 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Dnal1Q05A62 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Dnal1Q05A62 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Dnal1Q05A62 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Dnal1Q05A62 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms