Protein–RNA interactions for Protein: Q05A36

Mex3c, RNA-binding E3 ubiquitin-protein ligase MEX3C, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 652 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mex3cQ05A36 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Mex3cQ05A36 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Mex3cQ05A36 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Mex3cQ05A36 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Mex3cQ05A36 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Mex3cQ05A36 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Mex3cQ05A36 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Mex3cQ05A36 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Mex3cQ05A36 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Mex3cQ05A36 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Mex3cQ05A36 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Mex3cQ05A36 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Mex3cQ05A36 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Mex3cQ05A36 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Mex3cQ05A36 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Mex3cQ05A36 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Mex3cQ05A36 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Mex3cQ05A36 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Mex3cQ05A36 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Mex3cQ05A36 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Mex3cQ05A36 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Mex3cQ05A36 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Mex3cQ05A36 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Mex3cQ05A36 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Mex3cQ05A36 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Mex3cQ05A36 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Mex3cQ05A36 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Mex3cQ05A36 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Mex3cQ05A36 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Mex3cQ05A36 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Mex3cQ05A36 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Mex3cQ05A36 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Mex3cQ05A36 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Mex3cQ05A36 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Mex3cQ05A36 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Mex3cQ05A36 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Mex3cQ05A36 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Mex3cQ05A36 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Mex3cQ05A36 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Mex3cQ05A36 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Mex3cQ05A36 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Mex3cQ05A36 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Mex3cQ05A36 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Mex3cQ05A36 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Mex3cQ05A36 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Mex3cQ05A36 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Mex3cQ05A36 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Mex3cQ05A36 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Mex3cQ05A36 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Mex3cQ05A36 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Mex3cQ05A36 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Mex3cQ05A36 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Mex3cQ05A36 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Mex3cQ05A36 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Mex3cQ05A36 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Mex3cQ05A36 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Mex3cQ05A36 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Mex3cQ05A36 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Mex3cQ05A36 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Mex3cQ05A36 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Mex3cQ05A36 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Mex3cQ05A36 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Mex3cQ05A36 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Mex3cQ05A36 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Mex3cQ05A36 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Mex3cQ05A36 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Mex3cQ05A36 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Mex3cQ05A36 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Mex3cQ05A36 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Mex3cQ05A36 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Mex3cQ05A36 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Mex3cQ05A36 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Mex3cQ05A36 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Mex3cQ05A36 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Mex3cQ05A36 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Mex3cQ05A36 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Mex3cQ05A36 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Mex3cQ05A36 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Mex3cQ05A36 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Mex3cQ05A36 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Mex3cQ05A36 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Mex3cQ05A36 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Mex3cQ05A36 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
Mex3cQ05A36 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Mex3cQ05A36 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Mex3cQ05A36 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Mex3cQ05A36 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Mex3cQ05A36 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Mex3cQ05A36 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Mex3cQ05A36 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Mex3cQ05A36 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Mex3cQ05A36 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Mex3cQ05A36 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Mex3cQ05A36 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Mex3cQ05A36 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Mex3cQ05A36 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Mex3cQ05A36 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Mex3cQ05A36 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Mex3cQ05A36 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Mex3cQ05A36 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms