Protein–RNA interactions for Protein: Q05A06

Vmn1r236, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

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Length 334 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r236Q05A06 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Vmn1r236Q05A06 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Vmn1r236Q05A06 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Vmn1r236Q05A06 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Vmn1r236Q05A06 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Vmn1r236Q05A06 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Vmn1r236Q05A06 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Vmn1r236Q05A06 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Vmn1r236Q05A06 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Vmn1r236Q05A06 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Vmn1r236Q05A06 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Vmn1r236Q05A06 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Vmn1r236Q05A06 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Vmn1r236Q05A06 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Vmn1r236Q05A06 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Vmn1r236Q05A06 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Vmn1r236Q05A06 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Vmn1r236Q05A06 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Vmn1r236Q05A06 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Vmn1r236Q05A06 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Vmn1r236Q05A06 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Vmn1r236Q05A06 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Vmn1r236Q05A06 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Vmn1r236Q05A06 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Vmn1r236Q05A06 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Vmn1r236Q05A06 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Vmn1r236Q05A06 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Vmn1r236Q05A06 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Vmn1r236Q05A06 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Vmn1r236Q05A06 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Vmn1r236Q05A06 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Vmn1r236Q05A06 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Vmn1r236Q05A06 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Vmn1r236Q05A06 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Vmn1r236Q05A06 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Vmn1r236Q05A06 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Vmn1r236Q05A06 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Vmn1r236Q05A06 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Vmn1r236Q05A06 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Vmn1r236Q05A06 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Vmn1r236Q05A06 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Vmn1r236Q05A06 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Vmn1r236Q05A06 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Vmn1r236Q05A06 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Vmn1r236Q05A06 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Vmn1r236Q05A06 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Vmn1r236Q05A06 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Vmn1r236Q05A06 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Vmn1r236Q05A06 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Vmn1r236Q05A06 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Vmn1r236Q05A06 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Vmn1r236Q05A06 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Vmn1r236Q05A06 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Vmn1r236Q05A06 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Vmn1r236Q05A06 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Vmn1r236Q05A06 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Vmn1r236Q05A06 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Vmn1r236Q05A06 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Vmn1r236Q05A06 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Vmn1r236Q05A06 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Vmn1r236Q05A06 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Vmn1r236Q05A06 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Vmn1r236Q05A06 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Vmn1r236Q05A06 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Vmn1r236Q05A06 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Vmn1r236Q05A06 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Vmn1r236Q05A06 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Vmn1r236Q05A06 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Vmn1r236Q05A06 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Vmn1r236Q05A06 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Vmn1r236Q05A06 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Vmn1r236Q05A06 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Vmn1r236Q05A06 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Vmn1r236Q05A06 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Vmn1r236Q05A06 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Vmn1r236Q05A06 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Vmn1r236Q05A06 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Vmn1r236Q05A06 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Vmn1r236Q05A06 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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