Protein–RNA interactions for Protein: Q05909

Ptprg, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase gamma, mousemouse

Predictions only

Length 1,442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprgQ05909 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PtprgQ05909 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC24.7■■□□□ 1.55
PtprgQ05909 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
PtprgQ05909 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PtprgQ05909 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PtprgQ05909 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PtprgQ05909 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PtprgQ05909 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PtprgQ05909 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PtprgQ05909 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PtprgQ05909 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PtprgQ05909 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PtprgQ05909 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PtprgQ05909 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PtprgQ05909 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
PtprgQ05909 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PtprgQ05909 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PtprgQ05909 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PtprgQ05909 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PtprgQ05909 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PtprgQ05909 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PtprgQ05909 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PtprgQ05909 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PtprgQ05909 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
PtprgQ05909 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PtprgQ05909 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PtprgQ05909 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
PtprgQ05909 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PtprgQ05909 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PtprgQ05909 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PtprgQ05909 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PtprgQ05909 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PtprgQ05909 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PtprgQ05909 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PtprgQ05909 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PtprgQ05909 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PtprgQ05909 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PtprgQ05909 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PtprgQ05909 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PtprgQ05909 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PtprgQ05909 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PtprgQ05909 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PtprgQ05909 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PtprgQ05909 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PtprgQ05909 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PtprgQ05909 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PtprgQ05909 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
PtprgQ05909 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PtprgQ05909 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PtprgQ05909 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PtprgQ05909 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PtprgQ05909 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PtprgQ05909 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PtprgQ05909 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PtprgQ05909 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PtprgQ05909 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PtprgQ05909 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PtprgQ05909 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PtprgQ05909 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PtprgQ05909 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PtprgQ05909 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PtprgQ05909 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PtprgQ05909 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
PtprgQ05909 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PtprgQ05909 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PtprgQ05909 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PtprgQ05909 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PtprgQ05909 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PtprgQ05909 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PtprgQ05909 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PtprgQ05909 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PtprgQ05909 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PtprgQ05909 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PtprgQ05909 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
PtprgQ05909 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PtprgQ05909 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PtprgQ05909 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PtprgQ05909 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PtprgQ05909 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PtprgQ05909 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PtprgQ05909 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PtprgQ05909 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PtprgQ05909 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PtprgQ05909 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PtprgQ05909 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
PtprgQ05909 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PtprgQ05909 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PtprgQ05909 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PtprgQ05909 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PtprgQ05909 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PtprgQ05909 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PtprgQ05909 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PtprgQ05909 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PtprgQ05909 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PtprgQ05909 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PtprgQ05909 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PtprgQ05909 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PtprgQ05909 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PtprgQ05909 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
PtprgQ05909 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.7 ms