Protein–RNA interactions for Protein: Q04744

Emx2, Homeobox protein EMX2, mousemouse

Predictions only

Length 253 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Emx2Q04744 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Emx2Q04744 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Emx2Q04744 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Emx2Q04744 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Emx2Q04744 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Emx2Q04744 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Emx2Q04744 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Emx2Q04744 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Emx2Q04744 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Emx2Q04744 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Emx2Q04744 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Emx2Q04744 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Emx2Q04744 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Emx2Q04744 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Emx2Q04744 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Emx2Q04744 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Emx2Q04744 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Emx2Q04744 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Emx2Q04744 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Emx2Q04744 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Emx2Q04744 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Emx2Q04744 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Emx2Q04744 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Emx2Q04744 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Emx2Q04744 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Emx2Q04744 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Emx2Q04744 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Emx2Q04744 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Emx2Q04744 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Emx2Q04744 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Emx2Q04744 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Emx2Q04744 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Emx2Q04744 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Emx2Q04744 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Emx2Q04744 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Emx2Q04744 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Emx2Q04744 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Emx2Q04744 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Emx2Q04744 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Emx2Q04744 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Emx2Q04744 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Emx2Q04744 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Emx2Q04744 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Emx2Q04744 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Emx2Q04744 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Emx2Q04744 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Emx2Q04744 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Emx2Q04744 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Emx2Q04744 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Emx2Q04744 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Emx2Q04744 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Emx2Q04744 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Emx2Q04744 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Emx2Q04744 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Emx2Q04744 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Emx2Q04744 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Emx2Q04744 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Emx2Q04744 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Emx2Q04744 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Emx2Q04744 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Emx2Q04744 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Emx2Q04744 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Emx2Q04744 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Emx2Q04744 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Emx2Q04744 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Emx2Q04744 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Emx2Q04744 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Emx2Q04744 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Emx2Q04744 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Emx2Q04744 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Emx2Q04744 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Emx2Q04744 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Emx2Q04744 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Emx2Q04744 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Emx2Q04744 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Emx2Q04744 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Emx2Q04744 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Emx2Q04744 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Emx2Q04744 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Emx2Q04744 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Emx2Q04744 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Emx2Q04744 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Emx2Q04744 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Emx2Q04744 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Emx2Q04744 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Emx2Q04744 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Emx2Q04744 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Emx2Q04744 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Emx2Q04744 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Emx2Q04744 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Emx2Q04744 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Emx2Q04744 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Emx2Q04744 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Emx2Q04744 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Emx2Q04744 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Emx2Q04744 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Emx2Q04744 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Emx2Q04744 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Emx2Q04744 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Emx2Q04744 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms