Protein–RNA interactions for Protein: Q04692

Smarcad1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily A containing DEAD/H box 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,021 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarcad1Q04692 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Smarcad1Q04692 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Smarcad1Q04692 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Smarcad1Q04692 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Smarcad1Q04692 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Smarcad1Q04692 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Smarcad1Q04692 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Smarcad1Q04692 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Smarcad1Q04692 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Smarcad1Q04692 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Smarcad1Q04692 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Smarcad1Q04692 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Smarcad1Q04692 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Smarcad1Q04692 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Smarcad1Q04692 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Smarcad1Q04692 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Smarcad1Q04692 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Smarcad1Q04692 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Smarcad1Q04692 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Smarcad1Q04692 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Smarcad1Q04692 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Smarcad1Q04692 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Smarcad1Q04692 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Smarcad1Q04692 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Smarcad1Q04692 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Smarcad1Q04692 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Smarcad1Q04692 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Smarcad1Q04692 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Smarcad1Q04692 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Smarcad1Q04692 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Smarcad1Q04692 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Smarcad1Q04692 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Smarcad1Q04692 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Smarcad1Q04692 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Smarcad1Q04692 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Smarcad1Q04692 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Smarcad1Q04692 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Smarcad1Q04692 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
Smarcad1Q04692 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Smarcad1Q04692 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Smarcad1Q04692 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Smarcad1Q04692 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Smarcad1Q04692 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Smarcad1Q04692 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Smarcad1Q04692 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Smarcad1Q04692 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Smarcad1Q04692 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Smarcad1Q04692 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Smarcad1Q04692 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Smarcad1Q04692 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Smarcad1Q04692 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Smarcad1Q04692 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Smarcad1Q04692 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Smarcad1Q04692 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Smarcad1Q04692 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Smarcad1Q04692 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Smarcad1Q04692 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Smarcad1Q04692 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Smarcad1Q04692 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Smarcad1Q04692 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Smarcad1Q04692 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Smarcad1Q04692 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Smarcad1Q04692 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Smarcad1Q04692 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Smarcad1Q04692 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Smarcad1Q04692 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Smarcad1Q04692 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Smarcad1Q04692 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Smarcad1Q04692 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Smarcad1Q04692 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Smarcad1Q04692 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Smarcad1Q04692 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Smarcad1Q04692 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Smarcad1Q04692 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Smarcad1Q04692 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Smarcad1Q04692 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Smarcad1Q04692 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Smarcad1Q04692 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Smarcad1Q04692 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Smarcad1Q04692 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Smarcad1Q04692 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Smarcad1Q04692 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Smarcad1Q04692 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Smarcad1Q04692 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Smarcad1Q04692 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Smarcad1Q04692 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Smarcad1Q04692 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Smarcad1Q04692 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Smarcad1Q04692 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Smarcad1Q04692 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Smarcad1Q04692 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Smarcad1Q04692 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Smarcad1Q04692 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Smarcad1Q04692 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Smarcad1Q04692 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Smarcad1Q04692 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Smarcad1Q04692 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Smarcad1Q04692 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Smarcad1Q04692 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Smarcad1Q04692 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms