Protein–RNA interactions for Protein: Q04683

Cxcr5, C-X-C chemokine receptor type 5, mousemouse

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcr5Q04683 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cxcr5Q04683 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cxcr5Q04683 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cxcr5Q04683 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cxcr5Q04683 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Cxcr5Q04683 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cxcr5Q04683 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cxcr5Q04683 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cxcr5Q04683 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cxcr5Q04683 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cxcr5Q04683 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cxcr5Q04683 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cxcr5Q04683 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cxcr5Q04683 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cxcr5Q04683 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cxcr5Q04683 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cxcr5Q04683 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cxcr5Q04683 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cxcr5Q04683 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cxcr5Q04683 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cxcr5Q04683 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cxcr5Q04683 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cxcr5Q04683 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cxcr5Q04683 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cxcr5Q04683 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cxcr5Q04683 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Cxcr5Q04683 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cxcr5Q04683 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cxcr5Q04683 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cxcr5Q04683 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cxcr5Q04683 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cxcr5Q04683 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cxcr5Q04683 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cxcr5Q04683 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cxcr5Q04683 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cxcr5Q04683 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cxcr5Q04683 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cxcr5Q04683 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cxcr5Q04683 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cxcr5Q04683 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cxcr5Q04683 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cxcr5Q04683 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cxcr5Q04683 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cxcr5Q04683 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Cxcr5Q04683 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cxcr5Q04683 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cxcr5Q04683 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cxcr5Q04683 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cxcr5Q04683 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cxcr5Q04683 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cxcr5Q04683 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cxcr5Q04683 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cxcr5Q04683 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cxcr5Q04683 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cxcr5Q04683 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cxcr5Q04683 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cxcr5Q04683 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cxcr5Q04683 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cxcr5Q04683 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cxcr5Q04683 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cxcr5Q04683 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cxcr5Q04683 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cxcr5Q04683 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cxcr5Q04683 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cxcr5Q04683 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cxcr5Q04683 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cxcr5Q04683 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cxcr5Q04683 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cxcr5Q04683 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cxcr5Q04683 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cxcr5Q04683 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cxcr5Q04683 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cxcr5Q04683 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cxcr5Q04683 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cxcr5Q04683 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cxcr5Q04683 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cxcr5Q04683 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cxcr5Q04683 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cxcr5Q04683 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cxcr5Q04683 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cxcr5Q04683 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cxcr5Q04683 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cxcr5Q04683 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cxcr5Q04683 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cxcr5Q04683 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cxcr5Q04683 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cxcr5Q04683 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cxcr5Q04683 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cxcr5Q04683 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cxcr5Q04683 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cxcr5Q04683 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cxcr5Q04683 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cxcr5Q04683 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cxcr5Q04683 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cxcr5Q04683 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cxcr5Q04683 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cxcr5Q04683 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cxcr5Q04683 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cxcr5Q04683 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cxcr5Q04683 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms