Protein–RNA interactions for Protein: Q04447

Ckb, Creatine kinase B-type, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CkbQ04447 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CkbQ04447 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CkbQ04447 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CkbQ04447 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CkbQ04447 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CkbQ04447 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CkbQ04447 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CkbQ04447 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CkbQ04447 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CkbQ04447 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CkbQ04447 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CkbQ04447 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CkbQ04447 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CkbQ04447 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CkbQ04447 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CkbQ04447 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CkbQ04447 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CkbQ04447 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CkbQ04447 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CkbQ04447 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CkbQ04447 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CkbQ04447 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CkbQ04447 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CkbQ04447 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CkbQ04447 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CkbQ04447 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CkbQ04447 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CkbQ04447 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CkbQ04447 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CkbQ04447 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CkbQ04447 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
CkbQ04447 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CkbQ04447 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CkbQ04447 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CkbQ04447 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CkbQ04447 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CkbQ04447 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CkbQ04447 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CkbQ04447 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CkbQ04447 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CkbQ04447 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CkbQ04447 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CkbQ04447 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CkbQ04447 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CkbQ04447 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CkbQ04447 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CkbQ04447 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CkbQ04447 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
CkbQ04447 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CkbQ04447 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CkbQ04447 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
CkbQ04447 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CkbQ04447 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CkbQ04447 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
CkbQ04447 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CkbQ04447 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CkbQ04447 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
CkbQ04447 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CkbQ04447 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CkbQ04447 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CkbQ04447 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CkbQ04447 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CkbQ04447 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CkbQ04447 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CkbQ04447 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
CkbQ04447 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CkbQ04447 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CkbQ04447 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CkbQ04447 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CkbQ04447 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CkbQ04447 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CkbQ04447 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
CkbQ04447 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CkbQ04447 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CkbQ04447 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
CkbQ04447 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CkbQ04447 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
CkbQ04447 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CkbQ04447 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CkbQ04447 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CkbQ04447 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CkbQ04447 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CkbQ04447 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CkbQ04447 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CkbQ04447 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CkbQ04447 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CkbQ04447 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CkbQ04447 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CkbQ04447 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CkbQ04447 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CkbQ04447 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CkbQ04447 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CkbQ04447 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CkbQ04447 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CkbQ04447 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CkbQ04447 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CkbQ04447 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CkbQ04447 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CkbQ04447 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CkbQ04447 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms