Protein–RNA interactions for Protein: Q03517

Scg2, Secretogranin-2, mousemouse

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scg2Q03517 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC20.02■□□□□ 0.79
Scg2Q03517 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Scg2Q03517 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Scg2Q03517 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Scg2Q03517 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Scg2Q03517 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Scg2Q03517 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Scg2Q03517 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Scg2Q03517 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Scg2Q03517 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Scg2Q03517 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Scg2Q03517 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Scg2Q03517 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Scg2Q03517 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Scg2Q03517 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Scg2Q03517 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Scg2Q03517 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Scg2Q03517 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC20■□□□□ 0.79
Scg2Q03517 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Scg2Q03517 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Scg2Q03517 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Scg2Q03517 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Scg2Q03517 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Scg2Q03517 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Scg2Q03517 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Scg2Q03517 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Scg2Q03517 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Scg2Q03517 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Scg2Q03517 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Scg2Q03517 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Scg2Q03517 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Scg2Q03517 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Scg2Q03517 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Scg2Q03517 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Scg2Q03517 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Scg2Q03517 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Scg2Q03517 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Scg2Q03517 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Scg2Q03517 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Scg2Q03517 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Scg2Q03517 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Scg2Q03517 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Scg2Q03517 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Scg2Q03517 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Scg2Q03517 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Scg2Q03517 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Scg2Q03517 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Scg2Q03517 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Scg2Q03517 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Scg2Q03517 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Scg2Q03517 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Scg2Q03517 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Scg2Q03517 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Scg2Q03517 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Scg2Q03517 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Scg2Q03517 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Scg2Q03517 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Scg2Q03517 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Scg2Q03517 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Scg2Q03517 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Scg2Q03517 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Scg2Q03517 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Scg2Q03517 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Scg2Q03517 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Scg2Q03517 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Scg2Q03517 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Scg2Q03517 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Scg2Q03517 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Scg2Q03517 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Scg2Q03517 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Scg2Q03517 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Scg2Q03517 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Scg2Q03517 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Scg2Q03517 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Scg2Q03517 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Scg2Q03517 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Scg2Q03517 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Scg2Q03517 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Scg2Q03517 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Scg2Q03517 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Scg2Q03517 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Scg2Q03517 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Scg2Q03517 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Scg2Q03517 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Scg2Q03517 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Scg2Q03517 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Scg2Q03517 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Scg2Q03517 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Scg2Q03517 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Scg2Q03517 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Scg2Q03517 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Scg2Q03517 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Scg2Q03517 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Scg2Q03517 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Scg2Q03517 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Scg2Q03517 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Scg2Q03517 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Scg2Q03517 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Scg2Q03517 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Scg2Q03517 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms