Protein–RNA interactions for Protein: Q03146

Ddr1, Epithelial discoidin domain-containing receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddr1Q03146 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ddr1Q03146 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ddr1Q03146 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Ddr1Q03146 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ddr1Q03146 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ddr1Q03146 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ddr1Q03146 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ddr1Q03146 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ddr1Q03146 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ddr1Q03146 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Ddr1Q03146 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ddr1Q03146 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ddr1Q03146 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ddr1Q03146 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ddr1Q03146 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Ddr1Q03146 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ddr1Q03146 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Ddr1Q03146 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ddr1Q03146 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ddr1Q03146 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ddr1Q03146 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ddr1Q03146 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ddr1Q03146 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ddr1Q03146 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ddr1Q03146 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ddr1Q03146 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ddr1Q03146 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ddr1Q03146 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ddr1Q03146 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ddr1Q03146 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ddr1Q03146 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ddr1Q03146 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ddr1Q03146 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ddr1Q03146 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ddr1Q03146 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ddr1Q03146 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ddr1Q03146 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ddr1Q03146 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ddr1Q03146 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ddr1Q03146 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ddr1Q03146 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ddr1Q03146 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ddr1Q03146 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ddr1Q03146 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Ddr1Q03146 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ddr1Q03146 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ddr1Q03146 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Ddr1Q03146 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ddr1Q03146 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ddr1Q03146 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ddr1Q03146 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ddr1Q03146 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ddr1Q03146 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ddr1Q03146 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ddr1Q03146 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ddr1Q03146 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ddr1Q03146 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ddr1Q03146 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ddr1Q03146 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ddr1Q03146 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ddr1Q03146 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ddr1Q03146 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ddr1Q03146 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Ddr1Q03146 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ddr1Q03146 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ddr1Q03146 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ddr1Q03146 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ddr1Q03146 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ddr1Q03146 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ddr1Q03146 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Ddr1Q03146 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ddr1Q03146 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ddr1Q03146 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ddr1Q03146 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ddr1Q03146 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ddr1Q03146 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ddr1Q03146 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ddr1Q03146 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ddr1Q03146 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ddr1Q03146 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ddr1Q03146 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ddr1Q03146 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ddr1Q03146 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ddr1Q03146 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ddr1Q03146 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ddr1Q03146 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ddr1Q03146 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ddr1Q03146 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Ddr1Q03146 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Ddr1Q03146 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ddr1Q03146 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ddr1Q03146 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ddr1Q03146 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ddr1Q03146 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ddr1Q03146 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ddr1Q03146 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ddr1Q03146 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ddr1Q03146 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Ddr1Q03146 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Ddr1Q03146 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.3 ms