Protein–RNA interactions for Protein: Q02956

Prkcz, Protein kinase C zeta type, mousemouse

Predictions only

Length 592 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkczQ02956 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PrkczQ02956 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PrkczQ02956 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PrkczQ02956 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PrkczQ02956 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PrkczQ02956 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PrkczQ02956 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PrkczQ02956 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PrkczQ02956 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PrkczQ02956 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PrkczQ02956 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PrkczQ02956 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PrkczQ02956 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PrkczQ02956 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PrkczQ02956 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PrkczQ02956 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
PrkczQ02956 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
PrkczQ02956 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
PrkczQ02956 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC19.14■□□□□ 0.66
PrkczQ02956 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PrkczQ02956 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PrkczQ02956 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PrkczQ02956 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PrkczQ02956 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PrkczQ02956 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PrkczQ02956 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PrkczQ02956 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PrkczQ02956 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PrkczQ02956 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PrkczQ02956 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PrkczQ02956 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PrkczQ02956 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PrkczQ02956 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PrkczQ02956 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PrkczQ02956 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PrkczQ02956 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PrkczQ02956 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PrkczQ02956 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PrkczQ02956 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PrkczQ02956 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PrkczQ02956 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PrkczQ02956 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PrkczQ02956 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PrkczQ02956 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PrkczQ02956 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PrkczQ02956 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PrkczQ02956 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PrkczQ02956 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PrkczQ02956 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PrkczQ02956 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PrkczQ02956 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PrkczQ02956 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PrkczQ02956 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
PrkczQ02956 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PrkczQ02956 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PrkczQ02956 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PrkczQ02956 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PrkczQ02956 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PrkczQ02956 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PrkczQ02956 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PrkczQ02956 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PrkczQ02956 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PrkczQ02956 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PrkczQ02956 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PrkczQ02956 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PrkczQ02956 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PrkczQ02956 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PrkczQ02956 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PrkczQ02956 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PrkczQ02956 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PrkczQ02956 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PrkczQ02956 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PrkczQ02956 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
PrkczQ02956 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PrkczQ02956 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PrkczQ02956 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PrkczQ02956 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PrkczQ02956 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
PrkczQ02956 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PrkczQ02956 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PrkczQ02956 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PrkczQ02956 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PrkczQ02956 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PrkczQ02956 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PrkczQ02956 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PrkczQ02956 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PrkczQ02956 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PrkczQ02956 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
PrkczQ02956 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PrkczQ02956 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PrkczQ02956 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PrkczQ02956 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PrkczQ02956 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PrkczQ02956 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PrkczQ02956 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PrkczQ02956 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PrkczQ02956 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PrkczQ02956 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PrkczQ02956 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PrkczQ02956 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms