Protein–RNA interactions for Protein: Q02789

Cacna1s, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, mousemouse

Predictions only

Length 1,880 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1sQ02789 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cacna1sQ02789 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cacna1sQ02789 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Cacna1sQ02789 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Cacna1sQ02789 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Cacna1sQ02789 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Cacna1sQ02789 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cacna1sQ02789 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cacna1sQ02789 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cacna1sQ02789 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cacna1sQ02789 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cacna1sQ02789 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cacna1sQ02789 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cacna1sQ02789 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cacna1sQ02789 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cacna1sQ02789 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cacna1sQ02789 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cacna1sQ02789 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cacna1sQ02789 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Cacna1sQ02789 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cacna1sQ02789 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cacna1sQ02789 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cacna1sQ02789 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cacna1sQ02789 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cacna1sQ02789 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cacna1sQ02789 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cacna1sQ02789 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cacna1sQ02789 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cacna1sQ02789 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Cacna1sQ02789 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cacna1sQ02789 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Cacna1sQ02789 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cacna1sQ02789 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cacna1sQ02789 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cacna1sQ02789 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cacna1sQ02789 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cacna1sQ02789 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cacna1sQ02789 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cacna1sQ02789 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cacna1sQ02789 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Cacna1sQ02789 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cacna1sQ02789 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cacna1sQ02789 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cacna1sQ02789 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cacna1sQ02789 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cacna1sQ02789 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cacna1sQ02789 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Cacna1sQ02789 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cacna1sQ02789 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cacna1sQ02789 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cacna1sQ02789 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cacna1sQ02789 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cacna1sQ02789 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cacna1sQ02789 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cacna1sQ02789 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cacna1sQ02789 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cacna1sQ02789 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cacna1sQ02789 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cacna1sQ02789 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cacna1sQ02789 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cacna1sQ02789 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cacna1sQ02789 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cacna1sQ02789 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cacna1sQ02789 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cacna1sQ02789 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cacna1sQ02789 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cacna1sQ02789 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cacna1sQ02789 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cacna1sQ02789 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Cacna1sQ02789 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cacna1sQ02789 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cacna1sQ02789 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cacna1sQ02789 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cacna1sQ02789 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cacna1sQ02789 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cacna1sQ02789 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cacna1sQ02789 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cacna1sQ02789 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cacna1sQ02789 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cacna1sQ02789 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cacna1sQ02789 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cacna1sQ02789 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cacna1sQ02789 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cacna1sQ02789 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cacna1sQ02789 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cacna1sQ02789 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Cacna1sQ02789 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cacna1sQ02789 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Cacna1sQ02789 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cacna1sQ02789 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cacna1sQ02789 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cacna1sQ02789 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cacna1sQ02789 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cacna1sQ02789 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cacna1sQ02789 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cacna1sQ02789 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cacna1sQ02789 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cacna1sQ02789 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cacna1sQ02789 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Cacna1sQ02789 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms