Protein–RNA interactions for Protein: Q02739

Gjb5, Gap junction beta-5 protein, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb5Q02739 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gjb5Q02739 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gjb5Q02739 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gjb5Q02739 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gjb5Q02739 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gjb5Q02739 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Gjb5Q02739 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gjb5Q02739 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gjb5Q02739 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gjb5Q02739 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gjb5Q02739 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Gjb5Q02739 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gjb5Q02739 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gjb5Q02739 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gjb5Q02739 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
Gjb5Q02739 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Gjb5Q02739 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Gjb5Q02739 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Gjb5Q02739 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Gjb5Q02739 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gjb5Q02739 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Gjb5Q02739 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gjb5Q02739 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gjb5Q02739 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gjb5Q02739 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Gjb5Q02739 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gjb5Q02739 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gjb5Q02739 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gjb5Q02739 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gjb5Q02739 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gjb5Q02739 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gjb5Q02739 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gjb5Q02739 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gjb5Q02739 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gjb5Q02739 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gjb5Q02739 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gjb5Q02739 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gjb5Q02739 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gjb5Q02739 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gjb5Q02739 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gjb5Q02739 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Gjb5Q02739 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gjb5Q02739 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gjb5Q02739 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gjb5Q02739 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gjb5Q02739 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gjb5Q02739 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gjb5Q02739 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gjb5Q02739 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gjb5Q02739 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gjb5Q02739 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gjb5Q02739 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gjb5Q02739 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gjb5Q02739 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Gjb5Q02739 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gjb5Q02739 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gjb5Q02739 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gjb5Q02739 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gjb5Q02739 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gjb5Q02739 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gjb5Q02739 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gjb5Q02739 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gjb5Q02739 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gjb5Q02739 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gjb5Q02739 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gjb5Q02739 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gjb5Q02739 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gjb5Q02739 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gjb5Q02739 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gjb5Q02739 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gjb5Q02739 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Gjb5Q02739 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gjb5Q02739 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gjb5Q02739 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Gjb5Q02739 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gjb5Q02739 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gjb5Q02739 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gjb5Q02739 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gjb5Q02739 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gjb5Q02739 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gjb5Q02739 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gjb5Q02739 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gjb5Q02739 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gjb5Q02739 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gjb5Q02739 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Gjb5Q02739 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gjb5Q02739 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gjb5Q02739 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gjb5Q02739 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gjb5Q02739 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gjb5Q02739 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gjb5Q02739 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gjb5Q02739 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gjb5Q02739 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gjb5Q02739 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gjb5Q02739 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gjb5Q02739 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gjb5Q02739 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gjb5Q02739 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gjb5Q02739 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms