Protein–RNA interactions for Protein: Q02591

Gsc, Homeobox protein goosecoid, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GscQ02591 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GscQ02591 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GscQ02591 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GscQ02591 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GscQ02591 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GscQ02591 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GscQ02591 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GscQ02591 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GscQ02591 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GscQ02591 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GscQ02591 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GscQ02591 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GscQ02591 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GscQ02591 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
GscQ02591 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
GscQ02591 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
GscQ02591 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GscQ02591 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GscQ02591 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GscQ02591 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GscQ02591 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GscQ02591 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GscQ02591 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GscQ02591 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GscQ02591 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
GscQ02591 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GscQ02591 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GscQ02591 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GscQ02591 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GscQ02591 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GscQ02591 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GscQ02591 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GscQ02591 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GscQ02591 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GscQ02591 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GscQ02591 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GscQ02591 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GscQ02591 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GscQ02591 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GscQ02591 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GscQ02591 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GscQ02591 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GscQ02591 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GscQ02591 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GscQ02591 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GscQ02591 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GscQ02591 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
GscQ02591 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GscQ02591 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GscQ02591 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
GscQ02591 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
GscQ02591 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GscQ02591 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GscQ02591 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GscQ02591 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GscQ02591 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GscQ02591 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GscQ02591 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
GscQ02591 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GscQ02591 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GscQ02591 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GscQ02591 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GscQ02591 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
GscQ02591 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GscQ02591 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GscQ02591 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GscQ02591 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GscQ02591 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GscQ02591 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GscQ02591 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GscQ02591 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GscQ02591 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GscQ02591 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GscQ02591 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GscQ02591 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GscQ02591 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GscQ02591 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GscQ02591 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GscQ02591 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GscQ02591 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GscQ02591 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
GscQ02591 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GscQ02591 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GscQ02591 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GscQ02591 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GscQ02591 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GscQ02591 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GscQ02591 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GscQ02591 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GscQ02591 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GscQ02591 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GscQ02591 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GscQ02591 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GscQ02591 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GscQ02591 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GscQ02591 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GscQ02591 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GscQ02591 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GscQ02591 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GscQ02591 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms