Protein–RNA interactions for Protein: Q01853

Vcp, Transitional endoplasmic reticulum ATPase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 806 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VcpQ01853 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
VcpQ01853 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
VcpQ01853 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
VcpQ01853 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
VcpQ01853 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
VcpQ01853 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
VcpQ01853 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
VcpQ01853 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
VcpQ01853 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
VcpQ01853 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
VcpQ01853 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
VcpQ01853 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
VcpQ01853 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
VcpQ01853 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
VcpQ01853 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
VcpQ01853 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
VcpQ01853 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
VcpQ01853 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
VcpQ01853 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
VcpQ01853 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
VcpQ01853 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
VcpQ01853 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
VcpQ01853 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
VcpQ01853 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
VcpQ01853 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
VcpQ01853 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
VcpQ01853 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
VcpQ01853 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
VcpQ01853 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
VcpQ01853 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
VcpQ01853 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
VcpQ01853 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
VcpQ01853 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
VcpQ01853 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
VcpQ01853 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
VcpQ01853 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
VcpQ01853 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
VcpQ01853 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
VcpQ01853 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
VcpQ01853 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
VcpQ01853 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
VcpQ01853 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
VcpQ01853 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
VcpQ01853 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
VcpQ01853 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
VcpQ01853 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
VcpQ01853 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
VcpQ01853 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
VcpQ01853 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
VcpQ01853 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
VcpQ01853 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
VcpQ01853 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
VcpQ01853 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
VcpQ01853 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
VcpQ01853 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
VcpQ01853 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
VcpQ01853 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
VcpQ01853 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
VcpQ01853 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
VcpQ01853 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
VcpQ01853 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
VcpQ01853 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
VcpQ01853 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
VcpQ01853 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
VcpQ01853 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
VcpQ01853 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
VcpQ01853 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
VcpQ01853 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
VcpQ01853 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
VcpQ01853 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
VcpQ01853 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
VcpQ01853 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
VcpQ01853 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
VcpQ01853 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
VcpQ01853 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
VcpQ01853 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
VcpQ01853 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
VcpQ01853 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
VcpQ01853 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
VcpQ01853 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
VcpQ01853 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
VcpQ01853 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
VcpQ01853 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
VcpQ01853 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
VcpQ01853 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
VcpQ01853 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
VcpQ01853 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
VcpQ01853 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
VcpQ01853 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
VcpQ01853 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
VcpQ01853 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
VcpQ01853 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
VcpQ01853 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
VcpQ01853 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
VcpQ01853 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
VcpQ01853 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
VcpQ01853 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
VcpQ01853 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
VcpQ01853 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
VcpQ01853 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.1 ms