Protein–RNA interactions for Protein: Q01822

Hoxd1, Homeobox protein Hox-D1, mousemouse

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd1Q01822 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hoxd1Q01822 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hoxd1Q01822 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hoxd1Q01822 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hoxd1Q01822 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hoxd1Q01822 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hoxd1Q01822 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hoxd1Q01822 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hoxd1Q01822 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hoxd1Q01822 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hoxd1Q01822 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hoxd1Q01822 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hoxd1Q01822 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hoxd1Q01822 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hoxd1Q01822 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hoxd1Q01822 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hoxd1Q01822 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hoxd1Q01822 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hoxd1Q01822 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hoxd1Q01822 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hoxd1Q01822 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hoxd1Q01822 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hoxd1Q01822 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hoxd1Q01822 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hoxd1Q01822 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hoxd1Q01822 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Hoxd1Q01822 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hoxd1Q01822 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Hoxd1Q01822 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hoxd1Q01822 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hoxd1Q01822 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hoxd1Q01822 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hoxd1Q01822 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hoxd1Q01822 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hoxd1Q01822 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hoxd1Q01822 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hoxd1Q01822 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hoxd1Q01822 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hoxd1Q01822 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hoxd1Q01822 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hoxd1Q01822 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hoxd1Q01822 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hoxd1Q01822 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hoxd1Q01822 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Hoxd1Q01822 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hoxd1Q01822 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hoxd1Q01822 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hoxd1Q01822 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Hoxd1Q01822 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hoxd1Q01822 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hoxd1Q01822 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hoxd1Q01822 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hoxd1Q01822 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hoxd1Q01822 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hoxd1Q01822 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hoxd1Q01822 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hoxd1Q01822 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hoxd1Q01822 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hoxd1Q01822 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hoxd1Q01822 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hoxd1Q01822 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hoxd1Q01822 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hoxd1Q01822 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hoxd1Q01822 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hoxd1Q01822 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hoxd1Q01822 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hoxd1Q01822 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hoxd1Q01822 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hoxd1Q01822 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hoxd1Q01822 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hoxd1Q01822 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hoxd1Q01822 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hoxd1Q01822 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Hoxd1Q01822 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hoxd1Q01822 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hoxd1Q01822 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hoxd1Q01822 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hoxd1Q01822 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hoxd1Q01822 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hoxd1Q01822 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hoxd1Q01822 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hoxd1Q01822 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hoxd1Q01822 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hoxd1Q01822 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hoxd1Q01822 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hoxd1Q01822 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hoxd1Q01822 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Hoxd1Q01822 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Hoxd1Q01822 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hoxd1Q01822 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hoxd1Q01822 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hoxd1Q01822 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hoxd1Q01822 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hoxd1Q01822 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hoxd1Q01822 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hoxd1Q01822 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hoxd1Q01822 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hoxd1Q01822 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Hoxd1Q01822 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hoxd1Q01822 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.5 ms