Protein–RNA interactions for Protein: Q01768

Nme2, Nucleoside diphosphate kinase B, mousemouse

Predictions only

Length 152 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nme2Q01768 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Nme2Q01768 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nme2Q01768 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nme2Q01768 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nme2Q01768 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nme2Q01768 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nme2Q01768 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nme2Q01768 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nme2Q01768 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Nme2Q01768 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nme2Q01768 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nme2Q01768 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nme2Q01768 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nme2Q01768 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Nme2Q01768 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nme2Q01768 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nme2Q01768 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nme2Q01768 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nme2Q01768 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nme2Q01768 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nme2Q01768 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nme2Q01768 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nme2Q01768 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nme2Q01768 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nme2Q01768 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nme2Q01768 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nme2Q01768 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nme2Q01768 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nme2Q01768 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nme2Q01768 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nme2Q01768 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nme2Q01768 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nme2Q01768 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nme2Q01768 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nme2Q01768 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nme2Q01768 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nme2Q01768 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nme2Q01768 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nme2Q01768 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nme2Q01768 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nme2Q01768 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nme2Q01768 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nme2Q01768 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nme2Q01768 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Nme2Q01768 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Nme2Q01768 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Nme2Q01768 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nme2Q01768 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nme2Q01768 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nme2Q01768 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nme2Q01768 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nme2Q01768 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nme2Q01768 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nme2Q01768 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nme2Q01768 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nme2Q01768 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nme2Q01768 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nme2Q01768 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nme2Q01768 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nme2Q01768 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nme2Q01768 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nme2Q01768 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nme2Q01768 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nme2Q01768 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nme2Q01768 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nme2Q01768 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nme2Q01768 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nme2Q01768 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nme2Q01768 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Nme2Q01768 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nme2Q01768 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nme2Q01768 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nme2Q01768 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nme2Q01768 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nme2Q01768 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Nme2Q01768 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nme2Q01768 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nme2Q01768 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nme2Q01768 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nme2Q01768 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nme2Q01768 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nme2Q01768 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nme2Q01768 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nme2Q01768 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Nme2Q01768 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nme2Q01768 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nme2Q01768 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nme2Q01768 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nme2Q01768 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nme2Q01768 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nme2Q01768 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nme2Q01768 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Nme2Q01768 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nme2Q01768 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nme2Q01768 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nme2Q01768 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nme2Q01768 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nme2Q01768 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Nme2Q01768 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nme2Q01768 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms