Protein–RNA interactions for Protein: Q01320

Top2a, DNA topoisomerase 2-alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top2aQ01320 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.08
Top2aQ01320 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Top2aQ01320 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Top2aQ01320 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Top2aQ01320 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Top2aQ01320 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Top2aQ01320 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Top2aQ01320 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Top2aQ01320 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Top2aQ01320 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
Top2aQ01320 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Top2aQ01320 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Top2aQ01320 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Top2aQ01320 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Top2aQ01320 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Top2aQ01320 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Top2aQ01320 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Top2aQ01320 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Top2aQ01320 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Top2aQ01320 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Top2aQ01320 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Top2aQ01320 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Top2aQ01320 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
Top2aQ01320 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Top2aQ01320 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Top2aQ01320 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Top2aQ01320 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Top2aQ01320 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Top2aQ01320 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Top2aQ01320 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Top2aQ01320 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Top2aQ01320 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Top2aQ01320 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Top2aQ01320 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Top2aQ01320 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Top2aQ01320 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Top2aQ01320 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Top2aQ01320 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Top2aQ01320 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Top2aQ01320 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Top2aQ01320 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
Top2aQ01320 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Top2aQ01320 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Top2aQ01320 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Top2aQ01320 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Top2aQ01320 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Top2aQ01320 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Top2aQ01320 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Top2aQ01320 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Top2aQ01320 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Top2aQ01320 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Top2aQ01320 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Top2aQ01320 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Top2aQ01320 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
Top2aQ01320 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Top2aQ01320 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Top2aQ01320 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Top2aQ01320 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Top2aQ01320 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Top2aQ01320 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Top2aQ01320 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Top2aQ01320 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Top2aQ01320 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Top2aQ01320 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Top2aQ01320 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
Top2aQ01320 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
Top2aQ01320 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
Top2aQ01320 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Top2aQ01320 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC28.01■■■□□ 2.08
Top2aQ01320 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
Top2aQ01320 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
Top2aQ01320 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Top2aQ01320 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Top2aQ01320 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
Top2aQ01320 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
Top2aQ01320 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Top2aQ01320 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Top2aQ01320 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Top2aQ01320 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Top2aQ01320 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Top2aQ01320 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Top2aQ01320 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Top2aQ01320 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Top2aQ01320 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Top2aQ01320 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Top2aQ01320 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Top2aQ01320 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
Top2aQ01320 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Top2aQ01320 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Top2aQ01320 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Top2aQ01320 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Top2aQ01320 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Top2aQ01320 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Top2aQ01320 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Top2aQ01320 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Top2aQ01320 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Top2aQ01320 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
Top2aQ01320 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Top2aQ01320 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Top2aQ01320 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms